Aavikot sisältävät erilaisia sieniä. Jotkut autiomaa-sienityyppien pesäkkeet voivat elää miljoonia vuosia pidentämällä kehitysprosessia. Toiset luovat symbioottiset suhteet muihin organismeihin selviytymisen varmistamiseksi. Aavikon sienet voivat makaa lepotilassa autiomaassa, kunnes ne häiriintyvät, ja sitten hyökätä myrkyllisten itiöiden kanssa, jotka aiheuttavat vakavia sairauksia. Jotkut aavikkosienet voivat maalata aavikkokankaita kirkkailla väreillä.
Jäkälät
Jäkälät, jotka tunnetaan nimellä "pioneerikasvit", ovat pieniä organismeja, jotka kestävät karkeita, kuumia ja kylmiä ympäristöjä ja kuivuutta. Jäkälän runko tai tallus koostuu levistä ja sienistä, jotka kasvavat yhdessä symbioottisessa suhteessa. Leväsolut tarjoavat sienelle ravinteita, ja sieni suojaa levää ilmakehän olosuhteilta.
Jäkälät voivat kasvaa epätavallisilla pinnoilla, kuten hiekalla, kivillä, maaperällä, eläinten luilla ja ruosteisella metallilla. Jäkälät kasvavat joukossa värejä, kuten punaisen, oranssin, keltaisen, vihreän ja ruskean sävyjä. Yhdessä kivessä voi kasvaa yli tusina sienilajia.
Noin 15 000 jäkälälajia tunnetaan. Tietyt jäkälät, kuten crustose-jäkälät (kuorimainen sieni), voivat elää satoja tai tuhansia vuosia hitaan kasvun vuoksi. Kruusto-jäkälät voivat kehittyä kivillä. Tietyt jäkälät ovat uhanalaisia, koska saastunut ilma ja sadevesi voivat tuhota leväsolut ja tappaa sientäkumppanin.
Mycorrhizae
Mykoriisat ovat sienikasvijärjestelmiä, jotka kehittävät symbioottisen suhteen kasvien juuriin. Juuret tarjoavat tarvittavat ravintoaineet ja sivuston sienille kiinnittämään kierteensä. Sienet suojaavat laitosta hyökkäyksiltä, kuten taudinaiheuttajilta, ja niiden langat toimivat juurijärjestelmänä auttaakseen kasvia saamaan lisää vettä ja ravinteita. Kun suhde on kehittynyt, kasvi voi riippua Mycorrhizaesta, kun sen ravinteet lopetetaan.
Mykoriisat on jaettu kahteen tyyppiin - ektomykoriza ja endomykoriza. Ectomycorrhizae tuottaa peitteen kasvien juurien ympärillä. Peite kasvaa hifat (sienen rungon lankamaiset osat) juuriin, sitten maaperään. Endomycorrhizae-säikeet kasvavat soluihin ja sitten maaperään. Sieni parantaa kuivuuskestävyyttä, tautien vastustuskykyä ja ravinteiden saantia isäntäkasville.
Sienet
Podaxis tai aavikon takkuinen harja löytyy Sonoranin autiomaasta ja muista aavikoista ympäri maailmaa. Podaxis liittyy Agaricaceae-sieniperheeseen. Sieni muistuttaa pullistusta; se on puinen ja kuitumainen. Podaxiksen hedelmärunko lähtee autiomaasta, hiekkarannasta ja tienvarresta sadekauden jälkeen. Jos sade ei kuitenkaan tule, hedelmäkappale ei tule esiin. Pileus (korkki) pysyy suljettuna kehitysprosessin aikana suojaamaan hedelmällistä kudosta, kiduksia ja kaksiseinäisiä itiöitä kuivumiselta.
Kokkidioidit
Coccidioides-suku on maaperän sieni, johon kuuluu kaksi lajia - Coccidioides immitis ja Coccidioides posadasii. Molemmat lajit löytyvät Pohjois-ja Etelä-Amerikan autiomaasta. Jokainen laji luo maaperään hifaa ja itiöitä. Kun itiöt sisältävä maaperä häiriintyy ihmisistä tai luonnollisista hyökkäyksistä, kuten pölymyrskyistä, itiöt tulevat ilmassa. Itiöiden hengittäminen voi aiheuttaa ei-tarttuvan sieni-infektion, jota kutsutaan kokkidiodomykoosiksi tai laakson kuumeeksi. Harvinaisissa tapauksissa, jos lukemattomia itiöitä kummastakin lajista hengitetään, se voi olla hengenvaarallinen.