Maailmasta löytyy tuhansia erityyppisiä mehiläisiä. Vaikka useimmat mehiläislajit tekevät yleensä pesiä maahan, on useita, jotka rakentavat pesiä puihin. Nämä pesät löytyvät sekä kuolleista että elävistä puista. Mehiläisten pesien mahdollisuus puissa riippuu ympäristössä elävistä mehiläistyypeistä, alueesi puulajeista ja muun pesumateriaalin saatavuudesta.
Villimehiläiset, tieteellisellä nimellä Apis mellifera, rakentavat pesiä onttoihin puualueisiin. He eivät kaivu puiden läpi, mutta pesii vain jo olemassa oleviin onteloihin. Mehiläispesissä valmistetut hunajakampaat tehdään myös puissa. Mehiläiset käyttävät tätä pesää monta vuotta, kun työntekijät ja kuningattaret voivat selviytyä pesässä talvella.
Kimalaiset, Bombus-lajit, pesivät puissa, jos puulla on olemassa ontelo tai puussa on tyhjä linnunpesä. Perinteisesti ne pesivät maassa, mutta joskus ne löytyvät puista. Heidän puupesiään ei kuitenkaan löydy kovin korkealta, koska mehiläiset haluavat olla lähellä ravinnon lähdettä eli kukkia. Nämä eivät ole aggressiivisia mehiläisiä ja pistävät vain, jos pesä on vaarassa.
Useat piikkimehiläisten pesälajit puissa, vaikka nämä pesät löytyvät tyypillisesti trooppisilta alueilta. Kaksi mehiläistyyppiä Trigona-lajeissa luo pesänsä eläviin puihin, ja pesissä voi olla jopa 10000 aikuista mehiläistä. Mehiläiset eivät pesi kaiken tyyppisissä puissa. Kaikki piikkimehiläiset eivät pesää puissa, ja Lisotrigona carpenteri -mehiläiset tekevät vain pieniä pesiä ihmisen tekemissä rakenteissa oleviin seiniin.
Puuseppä mehiläiset luovat pesiä kuolleisiin puihin. He kaivavat kuolleita puita ja pehmeitä puita. He eivät voi kaivaa kuolleiden lehtipuiden läpi. Kahden tyyppisiä puuseppä mehiläisiä, joiden tiedetään rakentavan pesiä kuolleisiin puihin, ovat vihreä puuseppä mehiläis sekä keltainen ja musta puuseppä mehiläiset; molemmat Xylocopa-lajeissa. Jotkut puuseppälajin mehiläislajit ovat uhanalaisia, kun maaperän raivaaminen ja puuteollisuus ovat poistaneet näiden mehiläisten elinympäristöt.