Saasteella missä tahansa muodossa on kielteisiä vaikutuksia ympäristöön ja siinä asuviin kasveihin. Saastumisella on monia lähteitä jäteöljyn päästämisestä suoraan vesistöihin auton pakokaasujen aiheuttamaan ilman pilaantumiseen. Jotkut vaikutukset ovat lyhyitä ja helposti lievennettävissä. Muut vaikutukset ovat pitkäaikaisia, ja epäpuhtaudet jatkuvat ympäristössä tai kertyvät kasvikudoksiin. Fotosynteesi on olennainen prosessi ekosysteemissä. Kasvit tuottavat ruokaa ja energiaa auringonvaloa, hiilidioksidia ja vettä käyttämällä kemiallisessa prosessissa, joka tapahtuu kasvin lehdissä.
Otsoni ja lehdet
Kaasunvaihto lehtien huokosten tai stomatan kautta tarjoaa tarvittavan hiilidioksidin fotosynteesiin. Cellular and Molecular Life Sciences -lehdessä julkaistussa vuonna 1980 tehdyssä tutkimuksessa todettiin kuitenkin, että ilman pilaantuminen vähentää stomaten kokoa ja häiritsee kaasunvaihtoa. Riittämätön hiilidioksidi voi hidastaa tai pysäyttää fotosynteesin. Tätä tukee edelleen vuoden 2004 tutkimus, jonka mukaan ilmansaasteet vähentävät sadonkorjuuta.
Ei-pistelähde
Ei-tarkkuuslähde on pilaantumista, joka tulee monista eri lähteistä ja pääsee ympäristöön pintavesien valumisen kautta. Yhdysvaltain ympäristönsuojeluviraston (EPA) mukaan maatalouden vuoto on ensisijainen tämän tyyppinen saaste. Valuminen tuo torjunta-aineita ja lannoitteita vesistöihin. Joskus vaikutus on välitön ja kasvit kuolevat nopeasti. Lannoitteiden korkea fosforipitoisuus voi aiheuttaa leväkukintoja. Leväkukinnot perustavat skenaarion, jossa fotosynteesi hidastuu ja lopulta loppuu, kun liuenneen hapen määrä laskee vedessä ja sameat vedet estävät auringonvalon virtaamista vesiympäristöihin.
Maaperän pilaantuminen
Maaperän pilaantuminen vaikuttaa fotosynteesiin juuritasolla. Fossiilisten polttoaineiden päästöjen aiheuttama happama sade lisää maaperän happamuutta, mikä saa aikaan kemikaalin ja muodostaa myrkyllisiä alumiini-ioneja. Nämä ionit estävät kasvien kykyä omaksua ravinteita, mikä hidastaa fotosynteesiprosessia ja kasvin yleistä kasvua.
Kasvihuoneilmiö
Kasvihuoneilmiön aiheuttama maanpinnan otsoni voi luoda epäedulliset olosuhteet fotosynteesille. Kasvihuonekaasujen, kuten hiilidioksidin, pitoisuudet estävät säteilylämmön vapautumisen ympäristöstä. Pintalämpötilat nousevat, mikä lisää haihtumisnopeutta. Vedestä tulee rajoittava tekijä. Kallisarvoisten resurssien säästämiseksi kasvit sulkevat omat tilansa, mikä vähentää hiilidioksidin saatavuutta laitokselle. Hiilidioksidin ja veden rajallisuus fotosynteesi hidastuu.
Fyysinen vahinko
Saastuminen voi häiritä kasvin kykyä suorittaa fotosynteesi vahingoittamalla fyysisesti lehtiä siellä, missä sitä esiintyy. Otsoni aiheuttaa kloroosiksi kutsutun tilan, jossa kasvien lehdet kellastuvat riittämättömistä klorofyllitasoista. Klorofylli on elintärkeä fotosynteesin esiintymiselle. Jos tasot laskevat, myös fotosynteesi laskee. Suurina pitoisuuksina pilaantuminen voi tappaa kasvien rakenteet, mikä saa kasvit lopettamaan elintarviketuotannon selviytyäkseen ympäristökuormista.
