Vaikka luonnonvoimat voivat tuhota tai rasittaa eläinpopulaatiota, ihmisen toiminta on yhä useammin aiheuttanut suuren määrän eläinten uhan. Jotkut eläimet ja kasvit, varsinkin kotieläimet, kuten vilja, karja ja lemmikit, ovat hyötyneet ja jopa kukoistaneet ihmisen tekemistä muutoksista maailmalle. Joihinkin eläinpopulaatioihin on kuitenkin kohdistunut valtava paine näiden muutosten seurauksena, ja joissakin tapauksissa populaatiot laskevat merkittävästi alemmalle tasolle. Pienet populaatiot tai organismit, joilla on rajoitettu jakautuminen, ovat erittäin herkkiä tekijöille uhanalaisuudesta riippumatta siitä, luotetaanko sanan tavalliseen merkitykseen tai siinä esitettyyn uhanalaisten lajien määritelmään liittovaltion laki.
Elinympäristön menetys
Yksi uhanalaisten eläinten merkittävimmistä syistä on elinympäristön menetys. Vaikka elinympäristö voi kadota luonnonvoimien (ilmastonmuutos, geologiset muutokset) vuoksi, suuri osa menetetyistä elinympäristöistä johtuu ihmisen toiminnasta. Patojen, moottoriteiden, kanavien rakentaminen, kaupungistuminen ja maatalous vaikuttavat dramaattisesti alkuperäisten ekosysteemien asukkaisiin. Vaikka ekosysteemin osat pysyisivät ehjinä luoden "saaria", syntynyt elinympäristö voi olla liian pieni tai liian hajallaan lajien tukemiseksi.
Invasiiviset lajit
Invasiiviset lajit ovat yksi tärkeimmistä bioottisista syistä eläinten uhanalaisuuteen. Monet uuteen ekosysteemiin saapuvat lajit ovat huonosti sopeutuneita ja kuolevat nopeasti. Jotkut lajit pystyvät kuitenkin hyödyntämään ekosysteemiä alkuperäisten organismien vahingoksi. Pieniin ekosysteemeihin, kuten saarilla, vaikuttaa merkittävästi invasiivisten lajien tuonti, mutta jopa alkuperäiset manner - ja valtameripopulaatiot voivat tuhota kilpailun tai saaliin kautta hyökkääjä.
Resurssien liikakäyttö
Tietyn kalalajin liikakalastus on ilmeinen ja suora syy eläimen uhanalaan. Mutta myös muut ekosysteemin organismit voivat vahingoittaa (tai hyötyä niistä) tietyn lajin liikakäytöstä. Esimerkiksi huoli siitä, että Kalifornian merisaukko tuhosi abalonipopulaation, johti siihen merisaukoiden valitsematon tappaminen muuttamalla bioottisen kilpailun tasapainoa useiden välillä eliöt. Merisaukojen väheneminen johti merisiilien populaatioon, joka laidunsi rakkolevälautan paastoilla. Kun rakkolevä irtoaa pohjasta ja pestiin maihin, merilevimetsistä riippuvaiset organismit joutuivat lisääntyneen rasituksen alaisiksi.
Taudinaiheuttajat ja taudit
Kotieläinten leviäminen on levittänyt niihin liittyviä sairauksia myös uusille alueille maailmassa. Joissakin tapauksissa taudit tartuttivat alkuperäiskansoja, joilla oli vain vähän vastustuskykyä hyökkäävälle patogeenille. Nämä sairaudet voivat saavuttaa epidemiatasot alkuperäiskansassa, mikä vähentää niiden määrää.
Ympäristön saastuminen
Saastuminen monissa muodoissa on vaarantanut monia eläimiä. Ekosysteemiin tuotavat torjunta-aineet ja muut kemikaalit voivat vahingoittaa merkittävästi kohdistamattomia lajeja. Esimerkiksi hyttysten torjunnassa käytetty DDT liittyi lopulta lintujen lisääntymisasteen laskuun. Muut pilaantumisen muodot, kuten lämpö-, valo- ja melusaaste, voivat kukin vähentää paikallisten eläinpopulaatioiden eloonjäämisastetta.
