Eukarüootid on igasugused organismid, millel on keerulised rakud, mis hõlmavad mitokondreid, tuumasid ja muid rakuosi. Kolm peamist rakurühma on seened, taimed ja loomad. Paljud seened on taimedega seotud ainult pealiskaudsel viisil. Nad võivad sarnaneda mõnevõrra taimedega ja nende rakuseinad on sarnased taimerakkude seintele, kuid on olemas frenoloogiline puu, mis näitab, kuidas seened võivad olla loomadega tihedamalt seotud kui taimed. Kuna loomad on evolutsiooniajaloos seentele lähemal kui taimed, võiks öelda, et seen on inimesele lähedasem "sugulane" kui köögiviljad salatibaaris.
Valk
Seente valgujärjestused sarnanevad loomadega rohkem kui taimed. Näiteks näeb rakuline lima hallitusvalk välja pigem loomne kui taimne valk. Ribosoomide pikkus seentes näitab aminohapet, mis sarnaneb lihastega. Tegelikult on mitu aminohappelist järjestust, mis sarnanevad imetajate raske ahela valkudega. Üks neist aminohapetest on 81 protsenti identne inimese aminohapetega.
Klorofüll
Taimne tselluloos erineb seente tselluloosist. Röntgenpildil on taimne tselluloos kristallilisem kui seente tselluloos. Nii seened kui ka loomad ei sisalda kloroblaste, mis tähendab, et seened ega loomad ei suuda fotosünteesi töödelda. Klorofüll muudab taimed roheliseks ja tagab taimede toitumise. Seened omastavad ensüümprotsessi käigus lagunevast taimematerjalist toitaineid ja loomad neelavad oma toitu.
Kitiin
Seened ja loomad sisaldavad mõlemad polüsahhariidimolekuli, mida nimetatakse kitiiniks ja mida taimed ei jaga. Kitiin on kompleksne süsivesik, mida kasutatakse struktuurse komponendina. Seened kasutavad rakuseinte struktuuri elemendina kitiini. Loomadel sisaldub kitiin putukate eksoskeletis ja molluskite nokkides. Kitiin toimib sarnaselt taimse tselluloosiga, kuid kitiin on tugevam. Seente polüsahhariididega tehtud uuringud näitasid, et lämmastikku sisaldava leelise lisamine hävitas seened ja tootis äädikhapet. Neid keemilisi reaktsioone taime polüsahhariidides ei esinenud.
Seened ei ole vetikad
Vetikad on kõige lihtsamad ja ürgsemad taimed. 1955. aastal oli dr George W. Martin jõudis järeldusele, et seened pärinevad vetikatest, mis olid kaotanud klorofülli. Martini hüpoteesis ei arvestatud siiski, et atmosfääri tingimused võisid elu alguses olla teistsugused kui 1955. aastal. Samuti ei võtnud Martin arvesse, et lämmastikku siduvad bakterid oleksid võinud eksisteerida juba enne taimede arenemist, mida oleks võinud kasutada seente toiduallikana. 1966. aastal töötas dr A.S. Sussman märkis, et kuigi seened sarnanesid vetikatega pealiskaudselt, oli seentel selliseid aspekte nagu rakutuumad ja organiseeritus, mida ei suudetud seletada.
Steroolid
Mõned bioloogid on väitnud, et loomsed ja seenteroolid on erinevad, seetõttu ei saa seened olla loomadega sarnased. Loomad toodavad kolesterooli, seened aga ergosterooli. Lähemal uurimisel sisaldavad nii seen- kui ka loomsed steroolid lanosterooli, rohelistes taimedes sisalduvad fütosteroolid aga tsükloartenooli.
Kas see on oma kategooria?
Võib-olla ei ole seened saadud taimedest ega üherakulistest loomadest. Mõni bioloog on väitnud, et seened on fülogeneetiliselt kõigist teistest eukarüootidest erinevad. Seened näivad olevat ainulaadsed selle poolest, et ainuüksi nende jaoks on vajalik translatsiooni pikenemistegur, mida nimetatakse EF-3-ks. On mõned valgutegevused, mis on in vivo translatsiooni pikenemiseks hädavajalikud.