Kuidas määrata alleelide sagedusi

Deoksüribonukleiinhape, rahva seas tuntud kui DNA, on molekul, mida leidub enamuses Maal leiduvatest elusorganismidest ja viirustest. DNA kannab geneetiline teavevõi kood, mis muudab kõik, mis see on.

DNA erineb liigiti ja üksikute liikide lõikes. Näiteks inimestel määrab DNA inimese silmade värvi, naha, juuste, pikkuse ja kõik muud omadused, mis muudavad iga inimese ainulaadseks.

DNA koosneb erinevatest geenidest. Geenid kannavad geneetilist teavet igalt vanemalt.

Iga geen leitakse kromosoomi kindlast lookusest. Geenil võib olla mitu variatsiooni koosneb erinevatest alleelijärjestustest.

Alleelid määrata nähtavad individuaalsed omadused, nn fenotüübid. Näiteks sinine, roheline, pruun ja sarapuu on kõik inimsilma erinevad fenotüübid.

Vaadates ühte inimrühma paljudest silmavärvi geenidest, oleks siniste silmadega inimestel erinev alleelide järjestus kui pruunide, sarapuu ja roheliste silmadega.

Alleelisagedus on nende populatsioonide arv, kellel on a

See teave annab ülevaate populatsiooni geneetilisest mitmekesisusest. Kui alleeli sagedused aja jooksul registreeritakse, võib täheldada geneetilise mitmekesisuse muutusi.

Alleelisageduse arvutamiseks tuleb arvestada kogu populatsiooni isendite koguarv. Seejärel loendage üksikisikute arv, kellel kõigil on kõnealune konkreetne fenotüüp.

Looge kõigi kogusummade summa. Alleelisageduste leidmiseks jagage alleeli populatsioonis loendamiskordade arv selles geenis leitud alleeli koopiate koguarvuga.

Näiteks oletame, et populatsioonis on 100 isendit ja kahte tüüpi alleele, B siniste silmade ja G roheliste silmade puhul. Igal inimesel on igast alleelist kaks eksemplari, nii et korrutage kaks 100-ga, et saada populatsioonis 200 alleeli koopiat.

Tegelikus elus on palju geene, mis kodeerivad inimese silmavärvi, kuid selle stsenaariumi jaoks on selles geenivaramus ainult kolm erinevat alleelikombinatsiooni; BB, BG ja GG. Järgmisena loe iga alleelitüübiga inimeste arv populatsioonis.

Selles näites on BB-ga 50 inimest, BG-ga 23 ja GG-ga 27 inimest. Genotüüpsete sageduste leidmiseks jagage lihtsalt konkreetse fenotüübiga inimeste arv inimeste koguarvuga.

Sel juhul tähendab 50 BB jagatuna 100 inimesega seda, et 50 protsendil elanikkonnast on BB genotüüp. BG geenide sagedus oleks 23 protsenti ja 27 protsendil geenivaramus olevatest inimestest oleks GG geenitüüp.

Kui genotüüpsetes sagedustes vaadeldakse geenide ekspressiooni, siis alleelide sagedustes vaadeldakse konkreetse alleeli esinemiskordade arvu populatsioonis. Selle alleeli B alleelisageduse leidmiseks korrutage 50 kahega, kuna BB genotüübis on kaks B-d.

Seejärel lisage BG genotüübiga inimesed, kuna neil kõigil on ka B alleel, andes kokku 123 B alleeli. Lõpuks jagage 123 200-ga iga elanikkonna inimene kannab kahte alleeli, andes alleelisageduseks 0,615 ehk 61,5 protsenti.

Järgmisena tehke sama G alleeli puhul. Korrutades 27 inimest, kellel on GG alleelid, kahega ja liites 23 inimest, kellel on ka G alleel, jagades selle arvu, 77, 200-ga, saadakse 0,385 ehk 38,5 protsenti.

Kontrollige vigu, tagades, et kõik alleeli sagedused moodustavad 1 või 100 protsenti. Siin võrdub 38,5-le lisatud 61,5 100-ga.

Need arvutused on andnud teavet selle kohta, kui paljudel inimestel on sinise fenotüübi silmad ja kui paljudel on rohelise fenotüübi silmad selles 100 inimesega populatsioonis. Alleelsageduste põhjal on ilmne, et B-alleel on populatsioonis domineerivam.

Jätkates seda uuringut ka järgmistes põlvkondades, ilmneb, et alleeli sagedustes on aja jooksul muutusi ja see annab ülevaate elanikkonna areng.