Kuigi enamik DNA määratluste loend on geneetiline materjal, mis kodeerib valgusünteesini viivat teavet, fakt on see, et mitte kõik DNA kodeerib valke. Inimese genoom sisaldab palju DNA-d, mis ei kodeeri valke ega üldse midagi.
Suur osa sellest mittekodeerivast DNA-st on seotud reguleerimisega, millised geenid on sisse või välja lülitatud. Samuti on mitut tüüpi mittekodeeriv RNA, millest mõned aitavad valgu tootmisel ja teised seda pärsivad. Ehkki mittekodeerivad DNA ja RNA ahelad ei kodeeri valmistatavat valku otseselt, reguleerivad need paljudel juhtudel sageli, millistest geenidest valguks tehakse.
Geenikomponendid
Geen on DNA osa kromosoomis, mis sisaldab kogu vajalikku teavet RNA ja seejärel valgu valmistamiseks. Geeni piirkonda, mis kodeerib valku ja millest tehakse RNA, nimetatakse avatud lugemisraamiks ehk ORF-iks. ORF-i võimet teha RNA ja seejärel valku kontrollib DNA sektsioon, mida nimetatakse regulatiivseks piirkonnaks.
See DNA piirkond on väga oluline, kontrollides, millised geenid on sisse lülitatud ja lõpuks valguks tehtud, kuid see ei kodeeri ühtegi valku ise.
Mittekodeeriv RNA
Paljud DNA lõigud kodeerivad transkriptsiooniks ja translatsiooniks kasutatavate RNA masinate komponente. Need komponendid ei ole alati valgud. Tegelikult on paljud valmistatud ainult RNA tükkidest nagu tRNA ja mRNA.
Samuti on mitut tüüpi RNA-d, millest enamik valku ei kodeeri. Ribosomaalne RNA kodeerib ainult ribosoomi - kompleksi, mis muudab RNA valguks, tootmist. Transfer RNA on oluline valgu valmistamiseks RNA-st, kuid see ei kodeeri valgu enda tootmist.
Mikro-RNA ehk miRNA takistab valgu tootmist, suunates lagundava kodeeriva RNA. MiRNA aitab negatiivselt reguleerida, millised geenid muutuvad valguks, lülitades geenid sisuliselt välja. See geenide miRNA-ga väljalülitamise protsess on tuntud kui RNA-interferents.
Geenide splaissimine
Kui geen transkribeeritakse DNA-st RNA-ks, vajab saadud kodeeriv RNA või mRNA enne valgu valmistamist täiendavat töötlemist. MRNA koosneb järjestustest, mida nimetatakse introniteks ja eksoniteks. Intronid ei kodeeri ühtegi valku ja need eemaldatakse mRNA-st enne, kui sellest valk tehakse. Eksonid on järjestused, mis kodeerivad valku.
Kuid mõned eksonid eemaldatakse ka mRNA-st ja neist ei saa valku. See protsess intronite ja eksonite eemaldamiseks RNA-st on tuntud kui geenide splaissimine. Mõnikord on need eksonid valgu tootmise käigus järjestusest välja seotud ja teinekord need eksonid kaasatakse. See sõltub sellest, millist valku kodeeritakse.
Rämps DNA
Mõnel DNA-l puudub teadaolev eesmärk ja seetõttu nimetatakse seda rämps-DNA-ks. Rämps-DNA-d leidub tavaliselt telomeerides - kromosoomide otstes. Kromosoomide telomeerid lühenevad iga rakujagunemisega veidi ja aja jooksul võib märkimisväärne osa telomeeridest pärinevat DNA-d kaduda. Arvatakse, et telomeerid on valmistatud peamiselt rämps-DNA-st, nii et telomeeride lühendamisel ei kao oluline geneetiline teave.
Teine meeles pidav tegur on see, et see, et selles "rämpsu" DNA-s pole teadaolevat funktsiooni, ei tähenda, et see oleks tõesti rämps. Nende DNA osade funktsioon võib praegu olla lihtsalt teadmata või olla meie arusaamise ja meie praeguse tehnoloogia jaoks liiga keeruline.