Nii loodusliku kui ka kunstliku suhkru mõju üle on palju vaieldud. Üks põhjus on see, et mõisteid "looduslik" ja "kunstlik" suhkur kasutatakse mõnikord segaselt, kuna tootjad väidavad, et nende kunstlik suhkur on valmistatud looduslikest ainetest. Looduslikku suhkrut ekstraheeritakse aga sellistest taimedest nagu suhkruroog ja peet. Mesi või puuviljadest leitud suhkur on samuti loomulik. Kunstlik suhkur valmistatakse laborites sünteetiliste või looduslike ainetega. Nendel kahel suhkruliigil on mitmeid eeliseid ja puudusi.
Null kaloreid
Kunstsuhkrut kasutatakse loodusliku suhkru, näiteks valge suhkru ja melassi alternatiivina, selle nullkalorsuse tõttu. California ülikooli teadlaste tehtud uuring näitas, et fruktoos, looduslik suhkur, mida kasutatakse jookide ja kiirtoitude magustamiseks, aitab kaasa ülekaalulisusele. Juba paksud isikud said tohututes kogustes fruktoosi ja leiti, et nad suurendavad kaalu ümber kõhtu. Seda võrreldakse inimestega, kellele anti glükoosi (kunstlikku magusainet), kes kaalus alla võttis.
Madala kalorsusega
Kuigi kunstliku suhkru eeliseks on see, et see lisab dieedile null kalorit, on looduslikul suhkrul, näiteks lauasuhkrul, vähe kaloreid. Suhkruliidu andmetel on lauasuhkrus iga teelusikatäie suhkru kohta umbes 15 kalorit. Viisteist kalorit võib kaotada, kui teete igapäevaseid rutiinseid vahendeid nagu dušš või juukseid umbes kaheksa minutit.
Suu tervis
Kunstliku suhkru eeliseks on ka see, et see ei kahjusta suuõõne tervist, mis viib sellisesse hambakaariesesse. Seda seetõttu, et kunstlikku suhkrut moodustavad ained ei soodusta bakterite kasvu. Vastupidi, suhkruroo looduslik suhkur, mida kasutatakse sellistes toodetes nagu kommid, soodustab bakterite teket suus, mis viib naastude ja hambaaukudeni.
Suurenenud tarbimine
Kuna kunstlik suhkur ei lisa toidule kaloreid, on inimestel lihtne liiga palju tarbida toite, mis väidavad olevat kunstliku suhkru või magusainega. See on väärarusaam, mis võib tegelikult põhjustada kaalu kasvu, kuna inimene sööb rohkem toidukordi. Seetõttu ei võimalda kunstlik suhkur inimesel automaatselt kaalu vähendada, eriti kui ta tarbib liiga palju toitu.
Orgaanilised eelised
Kuigi teatud tüüpi loodusliku suhkru nagu fruktoos ja sahharoos (lauasuhkur) ületarbimine võib põhjustada rasvumist ja diabeeti, on teistel positiivsed omadused. Orgaaniliselt toodetud looduslikus suhkrus pole kunstlikke pestitsiide ja herbitsiide, mistõttu on selle tarbimine ohutum. Loodusliku orgaanilise suhkru söömine aitab kaasa ka keskkonnakaitsele ja saaste vähendamisele, kuna taimede, näiteks suhkruroo, kasvatamisel kasutatakse vähem kemikaale.