Neutrofiilsed ja atsetofiilsed heterotroofsed bakterid moodustavad suurema osa bakteriliikidest. Mõisted "neutrofiilsed" ja "atsetofiilsed" tähistavad bakteriliikide optimaalset pH-taset - aine happesuse või aluselisuse näitajat. Näiteks on äädikas happeline ja söögisooda aluseks. PH skaala jääb vahemikku 0–14, keskel on puhta vee pH 7.
Neutrofiilsed heterotroofid
Suurem osa bakteritest, neutrofiilidest, elavad mullas või vees ja kasvavad kõige paremini neutraalse pH väärtuse vahemikus 6–8. Kui pH varieerub sellest vahemikust väljaspool liiga kaugel, ei suuda neutrofiilsed bakterid ellu jääda. Enamik inimestel haigusi põhjustavatest bakteritest on ka neutrofiilsed heterotroofid, mis sobivad hästi inimese kehas ellujäämiseks.
Atsidofiilsed heterotroofid
Atsidofiilsed bakterid kasvavad paremini madalamal pH tasemel, tavaliselt pH 6 juures, kuna neil on bioloogilised mehhanismid, mis võimaldavad neil hoida oma sisemist pH peaaegu neutraalsena. Happekaevanduse drenaaž - saastunud, väga happeline äravool kaevandusaladelt - sisaldab suurt hulka asofiilide populatsiooni, mis oksüdeerivad metallimaagides leiduvat sulfiidi. Carletoni kolledži teadushariduse ressursikeskuse andmetel näitas happekaevanduse drenaažis leitud atsetofiil Ferroplasma pH-taset nii madal kui null.
Kohustuslikult atsidofiilsed heterotroofid
Kohustatud atsetofiilide ellujäämiseks on vajalik madal pH, alla 4 või 5. Kohustatud acidofiilide rakumembraan lahustub tegelikult neutraalse pH taseme juures, põhjustades rakusurma. Paljud kohustuslikud acidofiilid on ka termofiilid - organismid, mis kasvavad kõige paremini kõrgel temperatuuril - ja neid leidub tavaliselt vulkaanilistes muldades. Thiobacillus ferrooxidans kuulub tõenäoliselt kõige sagedamini uuritud rauda oksüdeeriva acidophilic bakterina.