Taksonoomia keskmes on organismide klassifitseerimine ja nimetamine. Teadlased klassifitseerivad organisme sarnaste omaduste põhjal. Et vältida segadust selles, mis on sarnasus, kehtestasid bioloogid klassifitseerimise reeglite kogumi. Taksonoomias on organismid paigutatud mitmetesse järjest spetsiifilisematesse rühmadesse ja neid nimetatakse rangete nimetamislepingute järgi.
Millised sarnasused?
Esimene asi, mida teadlased peavad organismide klassifitseerimisel arvestama, on see, millised sarnasused neil on. See, et kahel organismil on omadus, ei tähenda, et nad tuleks paigutada samasse rühma. Näiteks lendavad nii linnud kui ka mesilased, kuid nad teevad seda väga erinevate mehhanismide põhjal. Seda tüüpi sarnaseid jooni nimetatakse analoogseteks omadusteks; neid kasutatakse sama funktsiooni täitmiseks. Kuid bioloogid klassifitseerivad organisme hoopis homoloogiliste tunnuste põhjal. Homoloogsed omadused on oma sisemiste mehhanismide poolest sarnased. Näiteks on kotka tiival sisemisi sarnasusi flamingo tiibaga.
Klassifikatsioonitasemed
Bioloogid liigitavad organisme järjest spetsiifilisemate kategooriate hierarhia järgi. Selle hierarhia pakkus välja Carl Linnaeus 18. sajandil. Linné pakkus välja seitse kasvava spetsiifilisuse kategooriat: kuningriik, perekond, klass, kord, perekond, perekond ja liigid. Kui algselt kirjeldas Linné ainult taime- ja loomariiki, siis teiste mudelite seas on viis või enam kuningriiki. Mõnel kaasaegsel taksonoomilisel mudelil on ka laiem kategooria, mida nimetatakse kuningriigi kohal olevaks domeeniks. Organismi kõige spetsiifilisem taksonoomiline kategooria on selle liik. Üldiselt viitab see organismide rühmale, mis paljunevad selle rühma sees looduslikult.
Konventsioonide nimetamine
Linnenus kehtestas ka kõigi organismide jaoks ranged nimetamisviisid. Organismide teaduslikud nimed hõlmavad ladinakeelseid või ladinakeelseid versioone mitte-ladinakeelsetest sõnadest. Need nimed on kirjutamisel tavaliselt kursiivis. Teadusliku nime binoomversioonil on kaks osa: perekond ja liik. Näiteks on inimesed Homo sapiens. Homo on perekond ja sapiens on liik. Organismi liiginimi hõlmab tavaliselt perekonna nime esimest tähte, millele järgneb väiketäheline liiginimi. Näiteks on inimliigi nimi H. sapiens.
Rakendused
Taksonoomia asub suuremas bioloogia harus, mida nimetatakse süstemaatikaks. Süstemaatik on seotud nii organismide evolutsiooni ja sugulusega kui ka klassifitseerimisega. Seetõttu kasutavad bioloogid taksonoomia andmeid ja klassifikatsioone, et ehitada organismidele evolutsioonilisi puid. Bioloogid saavad neid diagramme koostada mitmete erinevate kriteeriumide põhjal ja neid skeemimeetodeid saab kasutada hüpoteeside loomiseks evolutsiooniajaloo kohta.
