Mikrobioloogia on mikroobide uurimine. "Mikrob" on üldmõiste, mis hõlmab kõiki üherakulisi organisme - baktereid ja arheesid, protiste ja mõningaid seeni; mõned väga väikesed mitmerakulised organismid; ja mitteorganismilised elutruud nähtused, viirused, prioonid, virionid ja viroidid. Paljud mikroskoopilised organismid moodustavad kolooniad. Mõne koloonia isikud põlvnevad kõik samast vanemrakust. Teistes kohtuvad vabalt elavad isikud, moodustades kolooniad teatud elutsükli etappides.
Nähtamatu nägemine
Kui kolooniad koosnevad mikroskoopilistest üksustest, on koloonia ise sageli nähtav. Mikrobioloogia kasutab uurimiseks ja diagnostikaks rakukultuuri - kolooniate, eriti bakterite ja seente tahtlikku kasvu. See hõlmab mikroobide või nakkusohtliku materjali proovide asetamist lahusesse kasvukeskkonna plaatidele ja nende inkubeerimist määratud aja jooksul. Seejärel uurib mikrobioloog kolooniate värvi, kuju, servi ja pinnaomadusi esimese sammuna mikroobide tuvastamisel.
Agent ja host
Escherichia coli on väga levinud kolooniat moodustav bakter. Tavaliselt esineb see paljude selgroogsete soolestikus ja enamiku selgroogsete väljaheites, kuid mõned virulentsed tüved põhjustavad rasket haigust. E. coli kolooniad on mikrobioloogialaborite tuttav omadus, kuna see bakter on oluline inimeste ja loomade tervisele. Neid kasutatakse ka erinevate viiruste aktiivsuse uurimiseks, kuna E koolirakud on ise teiste mikroobide ohvrid.
Veekogukond
Carchesium on ripsmetega magevee ja mere algloomade perekond. Nad kogunevad kolmepoolseteks kolooniateks seni, kuni täiesti nähtav tolli kaheksasosa. Kolooniad koosnevad sadadest isenditest, kes liiguvad koos nagu üks organism. Kolooniad eelistavad kinnituda lagunevale taimsele ainele, kus nad toituvad bakteritest, kuid moodustuvad teistel pindadel, sealhulgas elusate mereloomade nahad.
Vee lima
Klorofüüdid on üherakulised mageveelised rohevetikad. Nad võivad moodustada kolooniaid, mis näevad välja nagu elavad rohelise või punase lima lehed üle uputatud esemete või veepinnal. Hüdrodiktüoon on koloniaalklorofüütide perekond. Seda nimetatakse "veevõrguks" ja hiiglaslike, laienevate vanemrakkude sees moodustuvad paljude väiksemate uute rakkude kolooniad, mis võivad ise moodustada kolooniaid.
Lima kõndimine
Limasvormides on kolm üksteisega mitteseotud phylat, mis kõik on klassifitseeritud protistideks, kuigi mõned on mitmerakulised. Nad veedavad oma noorukid vabalt elavate, amööbitaoliste inimestena. Teatud tingimustel kogunevad need isikud ühtseks tervikuks, mille erinevad kehaosad moodustavad erinevad endised amööboidid. Limavorme peeti pikka aega koloonia mikroorganismide täiuslikeks näideteks, kuid edasised uuringud on seda teinud näitas, et koloniaalfaasid on palju sarnasemad mitmerakulistele organismidele kui teistele mikroobidele kolooniad.