Akadeemilistel või tutvustamiseks mõeldud mudelid muutuvad palju kasulikumaks, kui need on korralikult sildistatud. Sildid peavad olema täpsed, arusaadavad ja loetavad.
Mida keerukam on mudel, seda olulisemaks muutub korralik märgistamine. A DNA mudel korralikult tähistatud tähistab üht elu keerulisemat struktuuri, tundudes samas elegantselt lihtne.
DNA struktuur
Deoksüribonukleiinhape (DNA) struktuur näeb välja nagu keerutatud redel, mis on valmistatud kuuest erinevast osast. Redeli küljed koosnevad kahest osast, viiesüsinikust suhkrust, mida nimetatakse deoksüriboosiks, ja fosfaatmolekulist.
Redeli astmed moodustuvad paaridest lämmastikalused. Adeniin ja tümiin moodustavad ühe paari, tsütosiin ja guaniin aga teise paari.
Keemiliste struktuuride tõttu ühenduvad need alused ainult nendes paarides. Kui iga alust näidatakse erinevas värvitoonis, näiteks kollane adeniini ja sinine tümiini puhul, on vaatajal mudeli mõistmine palju lihtsam.
(Vt ressursid DNA-mudeli konstrueerimise harjutamiseks.)
Vesiniksidemed
hoidke lämmastikuga aluspaare koos, kuid laske paaridel eralduda, kui DNA molekul kordub. Sõltuvalt projekti juhistest võib neid vesiniksidemeid näidata või mitte. Vajadusel võib vesiniksidet DNA-mudelites näidata ühendajatena hambatikkude või väikeste magnetite abil või kujutada neid sära või sära liimiga.Projekti sildistamine
Sildid peavad olema loetavad. Väljamõeldud või keerukad fondid muudavad siltide lugemise ja mõistmise keerukamaks, seega kasutage lihtsaid ja hõlpsasti loetavaid fonte. Kasutage ka sobiva suurusega fonti. Mida suurem on vaataja kaugus mudelist, seda suurem peab olema fondi suurus.
Sildid peaksid sisaldama piisavalt teavet, et mudel oleks iseenesest mõistetav. Kõigi siltide jaoks sama või väga sarnase vormingu kasutamine aitab samuti aru saada.
DNA molekuli projekti sildistamine
Pärast konstrueerimist märkige DNA mudel ja selle osad selgelt ja täpselt. Lühikesed selgitused ja määratlused parandavad projekti oluliselt.
DNA-mudelil peaks olema suurem silt, sest see on kogu struktuuri nimi. Vajalik lisateave võib olla mudeli valmistaja nimi, ehitamise kuupäev või tähtaeg, juhendaja nimi ja klassi nimi.
Selgitus DNA molekul võib vaja minna ka projekti. Lõigete selgitamine eeldab tõenäoliselt vähemalt topeltheeliksi struktuuri kirjeldust ja lühikest arutelu DNA molekuli olulisuse üle.
Juhised võivad nõuda ka ehitise avastajate nimesid (Crick ja Watson Rosalind Franklini ja Maurice Wilkinsi tehtud röntgendifraktsioonipiltide abil). Järgige projekti juhiseid.
Märgistage fosfaatmolekul: Fosfaatmolekulid koosnevad nelja hapniku aatomiga ümbritsetud fosfaadi aatomist. Fosfaatmolekulid moodustavad sidemed piki DNA molekuli rööpaid või külgi. Väändus DNA struktuur tuleb osaliselt nendest molekulidest.
Märgistage desoksüriboosi molekul: DNA keerdredeli rööbaste või külgede teine osa on desoksüriboosi molekul. Deoksüribiroos on viiesuhkruline molekul, mida nimetatakse riboosiks ja mis on kaotanud hapniku aatomi (deoksü-). See molekul ühendub lämmastikuga aluse ristsidemetega või redelipulgad, DNA redeli.
Märgistage aluspaarid: Iga DNA redeli aste koosneb ühest aluspaarist, kas adeniinist ja tümiinist või guaniinist ja tsütosiinist. Nende nelja lämmastikuga aluse keemiline struktuur takistab muid kombinatsioone. Kui suunad nõuavad aluste suhtelise suuruse näitamist, on adeniin ja guaniin veidi suuremad molekulid.
Adeniin ja tümiin: Tavapraktika lubab adeniini tähistada A-tümiinina ja tümiini T-tähisena, kuid mudelil peab olema vähemalt üks samm täisnimede ja tähenimetustega.
Näiteks peaks üks adeniini lämmastikuline alus olema märgistatud adeniiniga (A) ja kinnitatud tümiini lämmastikuga alus olema märgistatud tümiiniga (T). Kui need sildid on selgelt esitatud, võib ülejäänud adeniini alused tähistada A-märgisega ja partner-tümiini tähisega T. Jällegi kontrollige juhiseid.
Guaniin ja tsütosiin: Tavapraktika lubab guaniini märgistada kui G ja tsütosiini kui C, kuid mudelil peab olema vähemalt üks samm täisnimede ja tähtede tähistusega.
Näiteks peaks üks guaniini lämmastikualus olema märgistatud Guaniiniga (G) ja kinnitatud tsütosiini lämmastikuga alus olema tähistatud tsütosiiniga (C). Õpetaja nõusoleku korral saab ülejäänud guaniinalused tähistada tähega G ja tsütosiinialused tähisega C.
Vesiniksidemed DNA-mudelis
Kui mudeli nõuded hõlmavad vesiniksideme näitamist, märkige vesiniksidemete asukohad hoolikalt adeniin- ja tümiinaluste, samuti guaniin- ja tsütosiinaluste vahel.
Kui silti ei saa vesiniksideme asukohta (kohtadele) täpselt asetada, asetage see võimalikult lähedale. Nooled, kui neid kasutatakse, peaksid ületama mudeli võimalikult vähe.
Nukleotiidi tuvastamine: A nukleotiid koosneb rühmast, mis sisaldab ühte fosfaatmolekuli, ühte desoksüriboosi molekuli ja ühte lämmastikalust. Ühte nukleotiidi identifitseeriv silt peaks selgelt näitama kolme ühendatud molekuli rühmana.
Nukleotiidi kolme osa etiketiga ühendamiseks võiks kasutada nooli, stringe või identifitseerivaid markereid, nagu sobivad tähekleebised.