Teadlastel oli kombeks protistid ühte kuningriiki kokku panna ja nad kasutavad seda klassifikatsiooni endiselt mõnel otstarbel. Kuid teadus on suures osas tunnistanud, et Kingdom Protista nime all tuntud taksonoomiline rühmitus hõlmab tegelikult laias valikus organisme, mis pole eriti seotud. Bioloogid on praegu oma klassifikatsiooni läbi vaatamas, et kajastada selle tohutu organismide komplekti evolutsioonilisi suhteid.
TL; DR (liiga pikk; Ei lugenud)
Bioloogid klassifitseerisid kõik protistid Kingdom Protista osaks, kuid peaaegu igal nende kirjeldamiseks kasutatud reeglil on mõni suurem erand. Nüüd üritavad nad selles kuningriigis organismide klassifikatsiooni läbi vaadata. Mõned teadlased on proovinud protiste sorteerida võrreldes kolme teise kuningriigiga: taime-, looma- ja seeneliikidega. See pole õnnestunud, sest paljudel protistidel on kahe või enama nimetatud kuningriigi omadused. Praegused klassifitseerimiskatsed keskenduvad protistide rühmitamisele kolme kuni kümne kuningriigi vahel, lähtudes liikide ühistest evolutsioonilistest esivanematest.
Meeletu mitmekesisus
Protistidel on märkimisväärne mitmekesisus. Peaaegu igal nende kirjeldamiseks kasutatud reeglil on mõni suurem erand. Mõned protistid elavad parasiitidena, teised kiskjatena ja kolmandad tootjatena. Mõnel on rakuseinad jäigad, teistel aga paindlikumad rakumembraanid. Nende liikumismeetodite hulka kuuluvad passiivne triivimine, ujumine lipukestega, ripsmetega ujumine ja pseudopoodidega hiilimine. Isegi teatud põhikriteeriume, mida on kasutatud rühma määratlemiseks, näiteks tuumade ja mitokondrite olemasolu, kas ei eksisteeri või omandavad need mõnes protistis veidrad vormid.
Riigiülesed omadused
Teadlased on püüdnud klassifitseerida protistides olevad organismid kas taime-, seene- või loomataolisteks. Geneetiline testimine ja lähedane uurimine on aga näidanud, et ka need kategooriad ei pea vastu. Näiteks on Euglenal nii taimetaoliste kui ka loomataoliste protistide omadused. Euglenal on kloroplastid nagu taimed, selles mõttes, et kloroplastid võimaldavad neil fotosünteesi abil päikesest energiat saada. Samal ajal on neil saba või lipuke, mida nad kasutavad ujumiseks, muutes nad liikuvaks, mis on loomadele väga sarnane omadus. Paljudel teistel protistidel on samuti omadused, mis raskendavad nende kõigi ühes rühmas või alagrupis hoidmist.
Sorteerimise katsed
Teadlased on hakanud protistide sorteerimiseks kasutama uusi kriteeriume. Tegelikult võib protiste jagada kolme kuni kümne kavandatava kuningriigi vahel, sõltuvalt sellest, millised teadlased sorteerimist teevad. Teadlased üritavad neid gruppe luua evolutsiooniliste suhete põhjal. Kuningriikide moodustamise eesmärk on koondada kõik järeltulijad ühisest esivanemast ühte rühma.
Täiuslikku reeglit pole
Protistide käsitlemine ühe rühmana võib toimida teatud bioloogiavaldkondades. Näiteks ei pruugi meditsiinis olla oluline, milline konkreetne protistlik riik põhjustab patsiendil infektsiooni, kui kõigi protistlike infektsioonide ravi on sama. Ainus tõeline pidev reegel on see, et kõik protistid on eukarüoodid, mis tähendab, et nad on organismid, millel on keerulisemad rakud kui bakterid. Enamikul protistidel on üks iseseisev rakk, kuigi mõned vetikad rikuvad seda reeglit. Enamikul protistidel on üks määratletud tuum, mis hoiab põhiosa nende DNA-st, ehkki mõnel ripsloomal on mitu tuuma ja lipukestel puudub määratletud tuum. Rühmana on raske leida määratlust, mis kõiki protiste ideaalselt kirjeldaks.