Bioloogia on mitmekesine teadusvaldkond, mis tegeleb peamiselt elusorganismide ja kõigega, mis on elusorganismidega seotud. Mikrobioloogia on bioloogia alavaldkond ja tegeleb peamiselt mikroorganismide uurimisega. Kuigi mikrobioloogia on alavaldkond, on sellel palju alavaldkondi, näiteks vee mikrobioloogia ja toidu mikrobioloogia.
Mikroskoobid
Üks peamisi erinevusi bioloogia ja mikrobioloogia vahel on see, et bioloogia uurimine võib sageli olla viiakse läbi ainult palja silmaga, samas kui mikrobioloogid sõltuvad nende mikroskoobidest peaaegu alati uuringud. Bioloogid kasutavad sageli mikroskoope, kuid paljud ei kasuta seda ja kasutavad oma uuringute läbiviimiseks muid vahendeid.
Konkreetsus
Teine erinevus bioloogia ja mikrobioloogia vahel on see, et mikrobioloogia on palju spetsiifilisem kui bioloogia. Mikrobioloogia on mitmekesine valdkond, kuid bioloogia hõlmab kõike alates geneetikast kuni biomehaanika ja paleontoloogiani. See suur mitmekesisus võimaldab bioloogidel näha suuremat pilti elavast maailmast, samas kui mikrobioloogia eripära annab fokuseerituma ülevaate selle loodusmaailma ühest konkreetsest piirkonnast.
Üksikud organismid
Bioloogia, nii mitmekesine kui see ka pole, on seotud kõigi erinevate suurusskaaladega, milles organismid eksisteerivad, kuid paljud bioloogia valdkonnad on seotud keerukamate organismidega, näiteks imetajatega. Mikrobioloogia tegeleb konkreetselt väiksemate, üksikute organismidega. Mikrobioloogid võivad olla mures nii suure kui bakterite pärast ja nad uurivad süsteeme, näiteks immuunsüsteemi, kuid üldiselt keskenduvad nad väiksematele üksikutele organismidele.
Ajalugu
Kahe valdkonna ajaloos on ka mõningaid olulisi erinevusi. Paljud edusammud bioloogias sõltusid mikroskoobi väljatöötamisest, mis on mikrobioloogide peamine vahend, kuid bioloogiat uuriti kaugel enne mikrobioloogia valdkonna leiutamist. Vana-Kreeka Hippokrates ja Aristoteles olid varased bioloogid, kes uurisid selliseid valdkondi nagu meditsiin ja ökosüsteemid. Kumbki poleks end bioloogidena identifitseerinud, sest see nimi tuli palju hiljem, kuid mõlemad uurisid elu ja loodusmaailma.