Joogivee puhastamine hõlmab saasteainete eemaldamist veeallikatest, mis võivad kahjustada võib ületada föderaalselt lubatud tasemeid, mis on kehtestatud teatud kemikaalidele ja looduslikult esinevatele ainetele mineraalid. Puhastusmeetodid varieeruvad sõltuvalt piirkonnast ja sellest, millised mineraalid ja kemikaalid on veeallikas kõige silmatorkavamad, kuid hõlmavad tavaliselt kemikaalide kasutamist.
Kloramiinid ja muud klooritaolised kemikaalid on kõige tavalisem viis joogivee puhastamiseks. Puhas kloor on ka tavaliselt kasutatav kemikaal, kuid see võib olla mürgine, kui seda käsitseda valel viisil või seda on liiga palju. Nii kloor kui ka klooramiinid hävitavad baktereid ja muid kahjulikke aineid, mida võib leida joogiveeallikatest.
Kloordioksiid on veel üks kloorist eraldumine, mida saab kasutada joogivee puhastamiseks ja puhastamiseks. Kuid seda ei kasutata enam nii sageli nii toodetava gaasi lenduvuse tõttu (mis on kergesti põlev) ja kuna see tõstab kloriidi taset, mis on ületanud Ameerika Ühendriikide soovitatud taseme valitsus.
Vesinikperoksiid on veel üks kemikaal, mida lisatakse joogiveele sageli selle puhastamiseks. Vesinikperoksiid kombineeritakse tavaliselt aktivaatoriga, mida nimetatakse sipelghappeks, ning toimib veevarustuses kahjulike algloomade ja patogeenide korral hästi. Vee puhastamine võtab aga kauem aega kui kloor ja kui seda ei kasutata õigesti, võib see muutuda fütotoksiiniks (või taimemürgiks, mis on võimeline piisavalt kõrge annusega inimesi tapma). See muudab ka vee pH taset, mis nõuab pH normaliseerimiseks täiendavaid kemikaale.