Teaduslaborites viiakse läbi kromatograafilised meetodid keemiliste ühendite eraldamiseks tundmatust proovist. Proov lahustatakse lahustis ja voolab läbi kolonni, milles see eraldatakse ühendi ligitõmbamise teel kolonni materjali vastu. See polaarne ja mittepolaarne külgetõmme kolonni materjali vastu on aktiivne jõud, mis põhjustab ühendite eraldumise aja jooksul. Kaks tänapäeval kasutatavat kromatograafiatüüpi on gaasikromatograafia (GC) ja kõrgefektiivne vedelikkromatograafia (HPLC).
Gaasikromatograafia aurustab proovi ja seda kannab süsteemi mööda inertgaas, näiteks heelium. Vesiniku kasutamine tagab parema eraldamise ja efektiivsuse, kuid paljud laborid keelavad selle gaasi kasutamise selle tuleohtliku olemuse tõttu. Vedelikukromatograafia kasutamisel jääb proov vedelasse olekusse ja surutakse läbi kolonni kõrgel rõhul erinevate lahustite nagu vesi, metanool või atsetonitriil abil. Iga lahusti erinevad kontsentratsioonid mõjutavad iga ühendi kromatograafiat erinevalt. Kui proov jääb vedelasse olekusse, suureneb ühendi stabiilsus.
Gaasikromatograafia kolonnidel on väga väike siseläbimõõt ja nende pikkus võib ulatuda 10 kuni 45 meetrini. Need ränidioksiidil põhinevad kolonnid keeratakse mööda ümmargust metallraami ja kuumutatakse temperatuurini 250 kraadi Fahrenheiti. Vedelkromatograafia kolonnid on samuti ränidioksiidil põhinevad, kuid neil on paks metallist kest, mis talub suurt hulka siserõhku. Need sambad töötavad toatemperatuuril ja jäävad vahemikku 50 kuni 250 sentimeetrit.
Gaasikromatograafias aurustatakse süsteemi süstitud proov enne kolonni kandmist umbes 400 kraadi Fahrenheiti juures. Seega peab ühend taluma kõrgel temperatuuril kuumust ilma, et see laguneks või laguneks teiseks molekuliks. Vedelkromatograafilised süsteemid võimaldavad teadlasel analüüsida suuremaid ja vähem stabiilseid ühendeid, kuna proov ei allu kuumusele.