Kodudes, ettevõtetes ja tööstuses kasutatav vesi puhastatakse kahjulike ainete ja bakterite eemaldamiseks sageli keemilise protsessi abil. Kui vesi on keemiliselt töödeldud, saab selle ohutult taaskasutada veeallikas. Vee töötlemiseks võib kasutada mitmeid erinevaid kemikaale, nagu kloor, lubi ja vesinikperoksiid. Iga meetod pakub veetöötluses kasutamiseks selgeid eeliseid ja puudusi.
Kloor
Vee kvaliteedi ja tervishoiu nõukogu andmetel enne klooritud joogivee kasutamist sajandil nõudsid vees levivad haigused nagu koolera, kõhutüüfus, düsenteeria ja hepatiit kumbki tuhandeid USA inimelusid aasta. Tänapäeval on kloorimine endiselt levinum üldkasutatava joogivee ja basseinide desinfitseerimismeetod. Kloorimine aitab mitte ainult vältida selliste infektsioonide levikut nagu E. coli, see hävitab ka bakterid, vetikad ja hallituse, mis võivad kasvada veemahutussüsteemide seintel ning eemaldab joogiveest ebameeldivad maitsed ja lõhnad. Kuigi kloorimine on tõhus joogivee desinfitseerimisel, võib seda asjatundmatuse ja kogemusteta olla keeruline käsitleda. Dušši all pesemiseks, pesuks ja ujumiseks kasutatava vee kloorimine võib nahka ja juukseid kuivatada, võib põhjustada silmade ärritust ja võib ka kangaid tuhmuda.
Pärn
Kõva vesi sisaldab suures koguses lahustunud mineraale, mis võivad veetorudesse ja sisemistesse süsteemidesse koguneda, põhjustades takistusi ja püsivaid kahjustusi. Hüdraaditud lubjaga valmistatud veepehmendajad saavad vee kvaliteeti töödelda, et parandada kõva vett ja vähendada joogivees sisalduva mürgise arseeni taset. Samuti muudab lubi vee pH ja hävitab bakterite ja viiruste kasvuks vajaliku keskkonna. Mõnel juhul muutub lubja pehmenemisel pH tase liiga kõrgeks. Kui klooritud veele lisatakse lubi, on sellest tulenev hüpokloriti moodustumine desinfitseeriv aine, mis on madalam kui teised vaba kloori jäägid.
Vesinikperoksiidi
Vesinikperoksiid on pleegitusaine, mida saab kasutada hammaste valgendamiseks, juuste heledamaks muutmiseks ning kangaste ja tekstiilide pleegitamiseks. Seda saab kasutada ka vee desinfitseerimiseks saasteainete eemaldamise ja bakteriaalsete ainete kasvu pidurdamise kaudu. Vesinikperoksiidi peetakse üldiselt ohutuks, see ei tekita jääke ega gaase ning seda saab kasutada kloorimisel järelejäänud kloorijääkide eemaldamiseks. Ainet tuleb transportida ja käsitseda ettevaatlikult, kuna kokkupuude vesinikperoksiidiga võib põhjustada silmade, naha, kopsude ja limaskestade ärritust. Lisaks märgib Lenntech, et Ameerika Rahvusvahelise Vähiuuringute Agentuuri uuringud näitavad, et vesinikperoksiidi kõrge kokkupuude loomadega võib olla kantserogeenne.