Seened mängivad olulist rolli energiaringluses ökosüsteemides ja nende vahel. Seeni leidub maismaa-, mere- ja mageveekeskkonnas ning nad on osa mitmekülgsest lagundajate kogukonnast, mis lagundab surnud taimi ja loomi. Peale seente kuuluvad sellesse kooslusesse bakterid, pisikesed selgrootud, näiteks nematoodid, ja suuremad selgrootud, näiteks teod, mardikad ja vihmaussid. Seened muudavad orgaanilise aine vormideks, mida teised lagundajad saavad kasutada, ja taimedele mõeldud toiduks.
Lagunemine
Seened elavad kõikjal, kus on niiskust. Neid võib leida palja silmaga nähtamatute üherakuliste organismidena, nagu pärm, ja mitmerakuliste organismidena, nagu seened. koosneb rakuharudest, mida nimetatakse "hüüfideks". Seened on nii laialt levinud ja arvukad, et nad moodustavad igal juhul suure osa biomassist ökosüsteem. Seened mängivad lagunemisprotsessis väga olulist osa, kuna need võivad lagundada karmid orgaanilised materjalid, näiteks tselluloos ja ligniin, mida selgrootutel on raske seedida. Seened vabastavad seedeensüüme, mida kasutatakse keerukate orgaaniliste ühendite metaboliseerimiseks lahustuvateks toitaineteks, nagu lihtsuhkrud, nitraadid ja fosfaadid. Erinevalt loomadest, kes seedivad toitu oma kehas, seedivad seened toitu väljaspool oma keha ja imavad seejärel toitaineid rakkudesse.
Toitainete jalgrattasõit
Taimed vajavad kasvu jaoks toitaineid, kuid toitaineid on mullas või vees harva vabalt saadaval, kuna need on lukustunud lahustumatutesse ühenditesse. Seepärast toetuvad taimed lagundajatele, et pakkuda neile lahustuvaid toitaineid, mida juured võivad omastada. Näiteks on lämmastik, üks olulisemaid taimetoitaineid, lukustatud valkudesse, mida taimed ei hõlma, kuigi mõned taimed on seda teinud. Seened metaboliseerivad valke ja vabastavad anorgaanilisi lämmastiku vorme, näiteks nitraati, mille taimejuured võivad hõlpsasti omastada. Mageveekeskkonnas on seened olulised energia ülekandmisel kaldametsast veeökosüsteemidesse, lagundades vette langenud puitu ja lehepuhanguid. Maismaasüsteemides kannavad seened energiat maapinnast selle alla, kus see taaskasutusse taimi suunatakse.
Sümbioos
Mõned seeneliigid moodustavad taimedega sümbiootilisi suhteid. Mükoriisa seened on seotud taime juurtega. See suhe on vastastikku kasulik, kuna seened hõlbustavad toitainete ülekandumist mullast taimejuurtesse ja saavad omakorda taimelt süsinikku. Seened varuvad seened mullas ja seetõttu ei eraldu süsinikdioksiidina. Kunagi arvati, et taimed on mükoriisaseenide ainus süsinikuallikas. 2008. aasta mai väljaandes “Funktsionaalne ökoloogia” avaldatud artikkel paljastab siiski, et mükoriisaseened võivad lagundavad orgaanilist süsinikku aktiivselt ja mängivad seetõttu varasemast suuremat rolli süsiniku kadumisel ja pinnase sisendil mõtles. Samblikud on teist tüüpi seened, mis moodustavad sümbiootilise suhte, kuid nad teevad seda tsüanobakteritega. Samblikud pakuvad bakteritele peavarju, mis omakorda toodavad samblikele fotosünteesi kaudu energiat ja süsinikku.
Toiduallikas
On palju loomi, kes sõltuvad toiduallikana osaliselt või täielikult seentest. Taimtoidulised imetajad kipuvad olema oportunistlikud seenetoitjad, kes söövad seeni, kui nad metsas sirvides sellega kokku puutuvad. Mõne looma puhul moodustavad seened siiski suure osa nende toidulauast. Näidetena võib tuua karibu, mis tugineb talvel toiduks palju samblikele, kui lehtköögiviljad pole saadaval ja pika ninaga potoroo, Austraalia imetaja, kelle dieet koosneb peaaegu täielikult seente viljast kehad. Paljud selgrootud elavad seeni ka nii oportunistlikult kui ka aktiivselt. Voolu selgrootud saavad lisaenergiat, kui nad söövad lagunevaid lehti, millel kasvavad seened. Tavaliselt täheldatakse banaaniloppe, mis toituvad seentest ja muudest seentest, mida nad näivad eelistavat teiste toitude suhtes.
