Auf der Erde treibt die Energie der Sonne die Winde an; Auf Neptun, wo die Sonne nicht viel größer als ein Stern erscheint, würde man also schwache Winde erwarten. Das Gegenteil ist jedoch der Fall. Neptun hat die stärksten Oberflächenwinde im Sonnensystem. Die meiste Energie, die diese Winde antreibt, kommt vom Planeten selbst.
Verglichen mit einem der Gasriesenplaneten ist die Erdatmosphäre ein Pool der Gelassenheit. Auf Jupiter erreichen die Winde am Little Red Spot 618 Stundenkilometer (384 Meilen pro Stunde), was fast doppelt so schnell ist wie die Winde beim stärksten terrestrischen Hurrikan. Auf Saturn können die Winde in der oberen Atmosphäre mit 1.800 Stundenkilometern fast dreimal stärker wehen. Selbst diese Winde treten in den Hintergrund gegenüber denen in der Nähe von Neptuns Great Dark Spot, die Astronomen mit 1.931 Stundenkilometern (1.200 Meilen pro Stunde) gemessen haben.
Wie Jupiter und Saturn erzeugt Neptun mehr Energie, als er von der Sonne erhält, und diese Energie, die vom Kern des Planeten ausgestrahlt wird, treibt die starken Oberflächenwinde an. Jupiter strahlt Energie aus, die von seiner Entstehung übrig bleibt, und die Energie, die Saturn ausstrahlt, ist größtenteils das Ergebnis der Reibung, die durch Heliumregen erzeugt wird. Auf Neptun fängt eine Decke aus Methan – einem Treibhausgas – Wärme ein. Wäre der Planet wie Uranus (dem eine innere Energiequelle fehlt), hätte diese Wärme schon vor langer Zeit in den Weltraum abgestrahlt. Obwohl die Temperaturen kalt sind, strahlt der Planet stattdessen 2,7-mal mehr Wärme ab, als er von der Sonne erhält, was ausreicht, um seine heftigen Winde anzutreiben.