Eukaryoten sind alle Arten von Organismen, die komplexe Zellen haben, die Mitochondrien, Kerne und andere Zellteile umfassen. Die drei großen Zellgruppen sind Pilze, Pflanzen und Tiere. Viele Pilze sind nur oberflächlich mit Pflanzen verwandt. Sie mögen Pflanzen ähneln und haben Zellwände, die Pflanzenzellwänden ähneln, aber es gibt einen Phrenologie-Baum, der zeigt, dass Pilze näher mit Tieren als mit Pflanzen verwandt sein können. Da Tiere in der Evolutionsgeschichte Pilzen näher stehen als Pflanzen, könnte man sagen, dass ein Pilz einem Menschen näher "verwandt" ist als Gemüse auf einer Salatbar.
Protein
Die Proteinsequenzen von Pilzen sind denen von Tieren ähnlicher als denen von Pflanzen. Zum Beispiel sieht das zelluläre Schleimpilzprotein eher wie tierisches Protein aus als pflanzliches Protein. Die Länge der Ribosomen bei Pilzen weist eine muskelähnliche Aminosäure auf. Tatsächlich gibt es mehrere Aminosäuresequenzen, die den Proteinen der schweren Kette bei Säugetieren ähnlich sind. Eine dieser Aminosäuren ist zu 81 Prozent mit einer menschlichen Aminosäure identisch.
Chlorophyll
Pflanzenzellulose unterscheidet sich von Pilzzellulose. Beim Röntgen ist Pflanzenzellulose kristalliner als Pilzzellulose. Sowohl Pilze als auch Tiere enthalten keine Chloroblasten, was bedeutet, dass weder Pilze noch Tiere die Photosynthese verarbeiten können. Chlorophyll macht Pflanzen grün und dient der Pflanzenernährung. Im Gegensatz dazu nehmen Pilze Nährstoffe aus zersetzendem Pflanzenmaterial durch einen enzymatischen Prozess auf, und Tiere nehmen ihre Nahrung auf.
Chitin
Pilze und Tiere enthalten beide ein Polysaccharidmolekül namens Chitin, das Pflanzen nicht teilen. Chitin ist ein komplexes Kohlenhydrat, das als Strukturkomponente verwendet wird. Pilze verwenden Chitin als Strukturelement in den Zellwänden. Bei Tieren ist Chitin im Exoskelett von Insekten und in den Schnäbeln von Weichtieren enthalten. Chitin funktioniert ähnlich wie pflanzliche Zellulose, aber Chitin ist stärker. Studien an Pilz-Polysacchariden zeigten, dass die Zugabe von Alkali, das Stickstoff enthält, Pilze zerstört und Essigsäure produziert. Diese chemischen Reaktionen traten bei pflanzlichen Polysacchariden nicht auf.
Pilze sind keine Algen
Algen sind die einfachsten und primitivsten Pflanzen. 1955 wurde Dr. George W. Martin kam zu dem Schluss, dass Pilze aus Algen stammen, die Chlorophyll verloren hatten. Martins Hypothese berücksichtigte jedoch nicht, dass die atmosphärischen Bedingungen zu Beginn des Lebens anders gewesen sein könnten als 1955. Martin berücksichtigte auch nicht, dass stickstofffixierende Bakterien schon vor der Entwicklung von Pflanzen existiert haben könnten, die den Pilzen als Nahrungsquelle dienen könnten. 1966 wurde Dr. A.S. Sussman beobachtete, dass Pilze zwar oberflächlich wie Algen aussahen, aber Aspekte von Pilzen, wie Zellkerne und Organisation, nicht erklärt werden konnten.
Sterole
Einige Biologen haben zitiert, dass Tier- und Pilzsterole unterschiedlich sind, daher können Pilze Tieren nicht ähnlich sein. Tiere produzieren Cholesterin, während Pilze Ergosterol produzieren. Bei näherer Betrachtung enthalten sowohl Pilz- als auch Tiersterole Lanosterol, während Phytosterine in grünen Pflanzen Cycloartenol enthalten.
Eine eigene Kategorie?
Vielleicht stammen Pilze weder von Pflanzen noch von einzelligen Tieren ab. Einige Biologen haben argumentiert, dass sich Pilze phylogenetisch von allen anderen Eukaryoten unterscheiden. Pilze scheinen insofern einzigartig zu sein, als sie allein einen Translationselongationsfaktor namens EF-3 benötigen. Es gibt einige Proteinaktivitäten, die für die Translationselongation in vivo essentiell sind.
