Klassifikationsstufen der Mikrobiologie

Im 19. Jahrhundert war die Taxonomie – die Klassifizierung lebender Organismen – in der Biologie der letzte Schrei. Sowohl Amateur- als auch professionelle Naturforscher waren so in den Wahn des Sammelns und Identifizierens von Kreaturen verstrickt, dass seltene Käfer heiße Waren waren. Damals war wenig über Mikroorganismen und ihren Platz in der Welt der Lebewesen bekannt, und die Klassifikation der Mikrobiologie wurde weniger beachtet. In den dazwischenliegenden Jahrzehnten hat sich das Wissen über Mikroben und die Methoden zur Identifizierung von Mikroorganismen, wobei ein Teil dieser Zunahme durch die effiziente Klassifizierung von Mikroorganismen.

Die Taxonomie besteht aus drei Komponenten: Nomenklatur, Klassifizierung und Identifizierung. Die Nomenklatur weist einer Art einfach einen Namen zu. Bei der Klassifizierung werden Arten nach gemeinsamen Merkmalen gruppiert – von denen einige physikalisch und einige biochemisch sind. Bei der Identifizierung werden Merkmale eines Organismus verwendet, um zu bestimmen, wo er in ein Klassifizierungsschema gehört. Das moderne taxonomische Schema hat die größte und umfassendste Gruppe, die Domänen. Die kleinste Gruppe sind die Arten. Von den umfassendsten bis zu den spezifischsten verlaufen die Ebenen wie folgt: Domäne, Königreich, Stamm, Klasse, Ordnung, Familie, Gattung und Art. Sie zum Beispiel sind Eukarya Animalia Chordata Mammalia Primate Hominidae Homo sapiens.

Mikroorganismen sind äußerst vielfältig. Sie werden nicht durch eine bestimmte Art von Struktur oder Funktion definiert, sondern einfach durch ihre Größe. Mikroorganismen sind so vielfältig, dass sie in alle drei der verschiedenen Top-Level-Klassifikationen fallen – in alle drei Domänen. Eine Domäne sind Bakterien, die andere sind Archaeen und die letzte ist Eukarya. Alle Mitglieder der Bakterien- und Archaea-Domänen sind einzellige Mikroorganismen. Beides sind Zellen ohne Membranen, die ihr genetisches Material vom Rest der Zelle trennen – Membranen, die einen Zellkern definieren. Alle Königreiche, Stämme, Klassen, Ordnungen, Familien, Gattungen und Arten innerhalb der Bakterien- und Archaeendomäne sind also Mikroorganismen.

Eukarya sind Organismen, deren Zellen einen Zellkern enthalten. Viele eukaryotische Organismen sind einzellige Mikroorganismen, aber viele andere – wie Mammutbäume oder Sie – sind es nicht. Daher sind zusätzliche Klassifizierungen erforderlich. Das Königreich Protista innerhalb der Domäne Eukarya besteht nur aus einzelligen Mikroorganismen. Die Protisten werden in drei verschiedene Stämme eingeteilt: vier verschiedene Algenstämme, vier verschiedene Protozoenstämme und zwei verschiedene Schimmelpilzstämme. Aber alle Organismen innerhalb dieser Stämme – alle innerhalb des Königreichs Protista – sind Mikroorganismen.

Das Königreich Fungi ist in der Domäne Eukarya enthalten. Einige der Stämme innerhalb der Pilze enthalten Mikroorganismen. Zum Beispiel enthält der Stamm Zygomycota mikroskopische Brotschimmel und der Stamm Ascomycota enthält Hefen und mikrobielle Pflanzenschädlinge und Parasiten. Flechten sind eine symbiotische Ansammlung eines Pilzes und eines photosynthetischen Organismus – teilweise im Königreich Pilze und teilweise in anderen Königreichen oder sogar anderen Domänen enthalten.