Interferenz berechnen

Chromosomales Crossover, auch genetisches Crossover genannt, ist ein normaler Prozess, bei dem Gene rekombinieren. Die Rekombination erhöht die genetische Variation durch Rekombination, um verschiedene Merkmale zu erzeugen.

TL; DR (zu lang; nicht gelesen)

Geninterferenz ist ein Maß für die Unabhängigkeit von Crossovers voneinander. Wenn eine Frequenzweiche in einer Region eine Frequenzweiche in einer anderen Region beeinflusst, wird diese Wechselwirkung als Interferenz bezeichnet. Interferenz = 1 − c.o.c., wobei c.o.c. ist der Koinzidenzkoeffizient (c.o.c.)

Der Mensch hat 23 Chromosomen. Während der Meiose teilt sich eine Zelle zweimal, um vier Tochterzellen zu bilden. Diese vier Tochterzellen haben die Hälfte der Chromosomenzahl der Mutterzelle. Sie können sich dann mit einer anderen chromosomalen Hälfte entweder aus der Eizelle oder dem Spermium verbinden, um ein ganzes Paar zu werden.

Manchmal bleiben diese beiden Teile nicht zusammen. Wenn die Stücke brechen, können sie sich mit einem anderen Bruchstück verbinden. Die beiden genetischen Kopien, die rekombinieren, werden Chromatiden genannt. Probleme wie das Down-Syndrom oder andere genetische Störungen können verursacht werden, wenn Gene falsch kombiniert werden.

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Die meisten Übergänge treten normal auf. Gelegentlich kommt es zu einem doppelten Crossover. Dies ist, wenn sich die Chromatiden an zwei Punkten statt an einem verbinden. An der zweiten Kontaktstelle können sich die Chromatiden wieder trennen und genetische Informationen wieder austauschen.

Geninterferenz ist ein Maß für die Unabhängigkeit von Crossovers voneinander. Mit anderen Worten, da Sie wissen, dass Doppelkreuzungen vorkommen, müssen Sie die Frage beantworten, ob Kreuzungen in benachbarten Chromosomenregionen unabhängig sind oder nicht. Wenn sie nicht unabhängig sind, bedeutet dies, dass ein Crossover in einer Region die Wahrscheinlichkeit eines Crossovers in einer benachbarten Region beeinflusst. Wenn eine Frequenzweiche in einer Region eine Frequenzweiche in einer anderen Region beeinflusst, wird diese Wechselwirkung als Interferenz bezeichnet.

Interferenz berechnen

Bei der Berechnung der Interferenz ist der erste Schritt die Berechnung des Koinzidenzkoeffizienten (c.o.c.). Die c.o.c. hängt wiederum von der Wahrscheinlichkeit eines doppelten Crossovers ab, dem sogenannten Crossover-Frequenzwert, der auch als "Frequenz doppelter Rekombinanten" bekannt ist.

Der Koinzidenzkoeffizient ist das Verhältnis der beobachteten zu den erwarteten Doppelrekombinanten.

Koinzidenzkoeffizient = Häufigkeit beobachteter Doppelrekombinanten / Häufigkeit erwarteter Doppelrekombinanten

Die erwartete Anzahl doppelter Rekombinanten in einer Stichprobe von zwei unabhängigen Regionen ist gleich dem Produkt der Rekombinantenhäufigkeiten in den benachbarten Regionen.

Interferenz wird dann wie folgt definiert:

Störung = 1 − c.o.c.

Interferenz gibt an, wie stark ein Crossover in einer der DNA-Regionen die Bildung eines Crossovers in der anderen Region stört.

Wenn die Interferenz null ist, bedeutet dies, dass die doppelten Übergänge wie vorhergesagt auftreten und dass ein Übergang in einem Bereich unabhängig von einem Übergang in einem benachbarten Bereich auftritt.

Wenn die Interferenz 1 ist, bedeutet dies, dass die Interferenz vollständig ist und keine doppelten Frequenzweichen vorhanden sind beobachtet, weil ein Crossover in einer Region die Wahrscheinlichkeit eines Crossovers in einem benachbarten. eliminiert Region.

Normalerweise weisen Ihre Daten eine Interferenz zwischen 0 und 1 auf. Werte über null, aber unter eins zeigen an, dass Interferenzen auftreten.

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