Bei der Reinigung von Trinkwasser werden alle Verunreinigungen aus Wasserquellen entfernt, die Schäden verursachen können oder die kann Werte über den vom Bund vorgeschriebenen Werten für bestimmte Chemikalien und natürlich vorkommende Stoffe anheben Mineralien. Die Reinigungsmethoden variieren je nach Gebiet und den Mineralien und Chemikalien, die in der Wasserquelle am häufigsten vorkommen, beinhalten jedoch normalerweise den Einsatz von Chemikalien.
Chloramine und andere chlorähnliche Chemikalien sind die gebräuchlichste Methode zur Reinigung von Trinkwasser. Reines Chlor ist ebenfalls eine häufig verwendete Chemikalie, kann jedoch bei falscher Handhabung oder in zu hohen Konzentrationen giftig sein. Sowohl Chlor als auch Chloramine wirken, um Bakterien und andere schädliche Substanzen abzutöten, die in Trinkwasserquellen vorkommen können.
Chlordioxid ist eine weitere Abspaltung von Chlor, die zur Aufbereitung und Reinigung von Trinkwasser verwendet werden kann. Es wird jedoch nicht mehr so oft verwendet, sowohl aufgrund der Flüchtigkeit des Gases, das es produziert (was leicht zu brennbar), und weil es den Chloritgehalt erhöht, hat er die von den Vereinigten Staaten empfohlenen Werte überschritten Regierung.
Wasserstoffperoxid ist eine weitere Chemikalie, die dem Trinkwasser häufig zugesetzt wird, um es zu reinigen. Wasserstoffperoxid wird normalerweise mit einem Aktivator namens Ameisensäure kombiniert und wirkt gut gegen schädliche Protozoen und Krankheitserreger in der Wasserversorgung. Die Reinigung des Wassers dauert jedoch länger als die von Chlor und kann bei unsachgemäßer Anwendung zu einem Phytotoxin (oder einem Pflanzengift, das Menschen in ausreichender Dosierung töten kann) werden. Es ändert auch den pH-Wert des Wassers, was zusätzliche Chemikalien erfordert, um den pH-Wert wieder auf den Normalwert zu bringen.