Strukturen af dobbeltstrenget DNA er universel i alle levende celler, men forskelle forekommer i metoderne til ekstraktion af genomisk DNA fra dyre- og planteceller. Selvom genomisk DNA lever i cellekernen, afhænger mængden og renheden af ekstraheret DNA af cellens type og størrelse. For eksempel indeholder visse celler mere DNA og urenheder end andre. Læs videre for at lære mere om forskelle i DNA-ekstraktion.
Generel DNA-ekstraktion
Hvis du behandler plante- og dyreceller med et sæbevand, nedbrydes det lipiderne i cellen og nukleare membraner. Derefter adskilles DNA-blandingen fra cellemembranerne og proteinerne. Dernæst kan du bruge alkohol til at udfælde DNA'et i opløsningen. Afhængig af mængden i prøven kan DNA være synligt med det blotte øje. Husk dog, at denne enkle procedure ikke nødvendigvis producerer DNA med høj renhed.
Plante- og dyreceller
Planteceller adskiller sig fra dyreceller på grund af deres stive cellevæg og organeller som chloroplast. De indeholder også proteiner og enzymer, der spiller en rolle i fotosyntese. Nogle planteceller har polyploidi, hvilket betyder at de har mere end en kopi af hvert kromosom pr. Celle. Derudover producerer cellulære processer, der forekommer i planter såsom fotosyntese, en række sekundære metabolitter. Dyreceller har ikke en cellevæg, men har stadig brug for kemikalier som natriumdodecylsulfat (SDS) for at ødelægge cellemembranen for at frigive genomisk DNA.
Plante-DNA-ekstraktion
Plant genomisk DNA er sværere at udvinde på grund af plantens cellevæg. Du kan fjerne det ved homogenisering eller ved at tilføje cellulase for at nedbryde den cellulose, der udgør cellevæggen. Derudover kan metabolitterne til stede i plantecellen interferere med genomisk DNA-ekstraktion ved at forurene DNA-prøven under udfældningsprocessen.
Animal DNA-ekstraktion
Perifere blodleukocytter er den vigtigste kilde til animalsk genomisk DNA, men prøveindsamling er vanskelig, fordi blodet skal komme direkte fra dyret. Blod indeholder en række forbindelser som proteiner, lipider, hvide blodlegemer, røde blodlegemer, blodplader og plasma, som kan forurene DNA-prøven. Imidlertid er den primære forurening af animalsk DNA ekstraheret fra blodprøver heme, som er den ikke-proteinkomponent af hæmoglobin.
DNA-forskellene
Forskellene mellem plante- og dyr-DNA ligger i rækkefølgen af baser i spiralen. Forbindelser fundet i planteceller er fraværende i dyreceller, og DNA-basesekvenser afspejler dette. Også genomisk plante-DNA er ofte større end animalsk DNA. Disse forskelle påvirker også ekstraktionsmetoder, udbytte og renhed af DNA.