I det 19. århundrede var taksonomi - klassificeringen af levende organismer - al raseri i biologien. Både amatører og professionelle naturforskere var så fanget i dille ved at samle og identificere skabninger, at sjældne biller var varme varer. På det tidspunkt vidste man ikke meget om mikroorganismer og deres plads i verdenen af levende ting, og klassificeringen af mikrobiologi fik ikke så meget opmærksomhed. De mellemliggende årtier har oplevet en dramatisk stigning i viden om mikrober og metoder til identificering af mikroorganismer, hvor en del af denne stigning demonstreres ved effektiv klassificering af mikroorganismer.
Komponenter i taksonomi
Taxonomi har tre komponenter: nomenklatur, klassificering og identifikation. Nomenklatur tildeler simpelthen et navn til en art. Klassificering er at gruppere arter efter fælles karakteristika - hvoraf nogle er fysiske og nogle biokemiske. Identifikation bruger funktioner i en organisme til at bestemme, hvor den hører hjemme i et klassificeringsskema. Den moderne taksonomiske ordning har som sin største, mest inkluderende gruppe, domænerne. Den mindste gruppe er arten. Fra det mest inkluderende til det mest specifikke løber niveauerne sådan: domæne, kongerige, fylum, klasse, orden, familie, slægt og art. Du er for eksempel Eukarya Animalia Chordata Mammalia Primate Hominidae Homo sapiens.
Mikroorganismer og domæner
Mikroorganismer er meget forskellige. De defineres ikke af nogen bestemt form for struktur eller funktion, men simpelthen af deres størrelse. Mikroorganismer er så dykkere, at de falder inden for alle tre forskellige topklassifikationer - alle tre domæner. Det ene domæne er bakterier, det andet er arkæer, og det sidste er eukarya. Alle medlemmer af bakterierne og arkæea domænerne er encellede mikroorganismer. De er begge celler uden membraner, der adskiller deres genetiske materiale fra resten af cellen - membraner, der definerer en kerne. Så alle kongeriger, phyla, klasser, ordener, familier, slægter og arter inden for bakterier og arkæer domæner er mikroorganismer.
Enkeltcellede protister
Eukarya er organismer, hvis celler indeholder en kerne. Mange eukaryote organismer er encellede mikroorganismer, men mange andre - såsom redwood træer eller dig - er det ikke. Så yderligere klassifikationer er nødvendige. Kongeriget Protista inden for domænet Eukarya består kun af encellede mikroorganismer. Protisterne er adskilt i tre forskellige grupper af phyla: fire forskellige alge phyla, fire forskellige protozoa phyla og to forskellige mold phyla. Men alle organismer inden for disse phyla - alle inden for kongeriget Protista - er mikroorganismer.
Mikroskopiske svampe
Kongeriget svampe er indeholdt i domænet Eukarya. Nogle af phylerne i svampene indeholder mikroorganismer. For eksempel indeholder stammen Zygomycota mikroskopiske brødforme, og stammen Ascomycota indeholder gær og mikrobielle afgrødedyr og parasitter. Lav er en symbiotisk samling af en svamp og en fotosyntetisk organisme - indeholdt dels inden for kongeriget svampe og dels i andre kongeriger eller endda andre domæner.
