Sådan beregnes det isoelektriske punkt for peptider

Peptider er korte polymerfragmenter sammensat af aminosyrer. Hvert peptid har en bestemt aminosyresekvens betegnet med en kode på tre bogstaver eller en bogstav; for eksempel forkortes aminosyren alanin som "Ala" eller "A." Opladningen af ​​peptiderne i opløsningen afhænger af opløsningens surhed. Det isoelektriske punkt (pI) henviser til opløsningens surhedsværdi, hvor peptidmolekylet har nettoladningen nul. Peptidets opløselighed er minimal ved det isoelektriske punkt. Brug tilgængelige webservere til at beregne pI-værdien for en peptidaminosyresekvens.

Skriv peptidsekvensen ved hjælp af enbogstavskoden. For eksempel, hvis et peptid har en aminosyresekvens Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (Alanin — Serin — Glumatinsyre — Leucin — Prolin), så er sekvensen på et bogstav "ASELP." Hvis det er nødvendigt, se de tre bogstaver til et brev konverteringstabel angivet i Ressourcer.

Brug f.eks. En hvilken som helst webbrowser, Internet Explorer eller Firefox til at navigere til en server, der beregner peptidets isoelektriske punkt (pI); se Ressourcer.

Læs den isoelektriske punktværdi (pI), der er angivet i linjen "Teoretisk pI / Mw." I vores eksempel er pI 4,00. Bemærk, at serveren også beregner peptidets molekylvægt (Mw).

Om forfatteren

Oxana Fox er en freelance skribent med speciale i medicin og behandling, computersoftware og hardware, digital fotografering og finansielle tjenester. Hun dimitterede fra Moscow Medical College i 1988 med formel uddannelse i pædiatri.

Fotokreditter

Comstock Images / Comstock / Getty Images

  • Del
instagram viewer