Jakmile provedete vzorky DNA na agarózovém gelu a pořídíte snímek, můžete obrázek uložit na později, poté můžete výsledky analyzovat a interpretovat. Druhy věcí, které hledáte, budou záviset na povaze vašeho experimentu. Pokud například děláte otisky prstů DNA, budete chtít porovnat velikost kousků DNA ze dvou vzorků - možná od podezřelého a ze vzorku z místa činu. Pokud pracujete s plazmidy bakterií, budete možná muset zajistit, aby plasmid obsahoval inzert. To, jak interpretujete svůj gel, bude tedy částečně záviset na experimentu, který jste provedli. Můžete však použít některá obecná pravidla.
Pamatujte, že možná budete muset použít pokyny v této části, ale možná nebudete muset. Elektroforéza na agarózovém gelu se často používá k potvrzení, že plazmid obsahuje daný inzert. Pokud nepracujete s plazmidy, můžete tuto část přeskočit. Pokud ano, můžete postupovat podle těchto pokynů.
Všimněte si, že pokud pracujete s nesestříhanými nebo zaseknutými plazmidy, nemůžete odhadnout velikost pomocí postupu z části 1 výše. Je to proto, že nesestříhané a přezdívané plazmidy migrují různou rychlostí z lineární DNA.
Porovnejte počet pásem v každém pruhu. Připomeňme, že restrikční enzym štěpí DNA na místech, kde se vyskytuje daná sekvence nazývaná restrikční místo. Pokud byl vzorek ošetřen DVOU restrikčními enzymy, měl by být přítomen pás pro inzert i pás pro zbytek plazmidu. Je to proto, že inzert bude lemován dvěma restrikčními místy, každé pro jiný enzym, takže řezy na obou těchto místech uvolní inzert z plazmidu. Výřez pouze na jednom místě naopak převede plazmid na lineární DNA. Vzorek nařezaný bez restrikčních enzymů nebo jednoho restrikčního enzymu by pak měl obsahovat jeden pás, zatímco vzorek nařezaný dvěma restrikčními enzymy by měl obsahovat dva pruhy.
Dávejte pozor na pruhy vytvořené plazmidovou DNA. Proříznutý plazmid má řez pouze v jediném řetězci, takže migruje pomaleji než řezaný plazmid. Řezané plazmidy zase migrují pomaleji než neřezaná DNA.
Odhadněte velikost vložky pomocí postupu popsaného v části 1 a určete, zda odpovídá vašim očekáváním (která se bude lišit v závislosti na experimentu.)
Věci, které budete potřebovat
- Tužka
- Papír
- Tabulkový program
- Obrázek vašeho gelu
- Pravítko