Zahajte proces identifikace neznámých bakterií pozorováním jejich fyzikálních vlastností, jako je buněčná stěna, tvar a vazby. K dalšímu zúžení vaší identifikace použijte standardní laboratorní postupy, jako je barvení buněk, kultivace a sekvenování DNA. Bakterie jsou obecně seskupeny do druhů podle jejich fyzických a metabolických vlastností, spíše než podle jejich vzájemných genetických vztahů.
Pozitivní nebo negativní
Eubakterie jsou takzvané pravé bakterie. Liší se od archaeí nebo archebakterií, které tvoří samostatné království. Eubakterie jsou prokaryoty, což znamená, že jim chybí jaderná membrána. Většina z nich má buněčné membrány a buněčné stěny. Bakterie se silnými buněčnými stěnami se označují jako grampozitivní, protože jsou náchylné k umírání během testu zvaného Gramovo barvení. Gramovo barvení je prvním testem používaným v bakteriální klasifikaci. Bakterie s tenkými nebo chybějícími buněčnými stěnami jsou gramnegativní, protože nezachytávají barvicí barvivo Gram.
Formování bakterií
Sférické bakterie se nazývají koky, bakterie, které tvoří přímé tyčinky, se nazývají bacily a bakterie se středním tvarem se nazývají kokobacily. Všechny mohou být gramnegativní nebo grampozitivní. Tuhé bakterie ve tvaru spirály jsou známé jako spirilla a jsou pouze gramnegativní. Pružné, nezávisle mobilní, spirálovité bakterie se nazývají spirochety a jsou gram-neutrální. Nakonec se tuhé tyčinky ve tvaru čárky nazývají vibrio a jsou gramnegativní. Několik málo známých a špatně pochopených bakterií má různé tvary, například hvězdicovitou stellu a labrys ve tvaru sekery. Existují také dvě střední bakteriální skupiny. Rickettsie jsou podobné virům, mají různé tvary, jsou gramnegativní a mohou přežít pouze v jiných buňkách. Mykoplazma, podobné houbám, postrádá buněčné stěny a zahrnuje mnoho druhově specifických plicních patogenů způsobujících zápal plic.
Kostky, klastry a další propojení
Koky a bacily jsou dále klasifikovány podle vazeb, které tvoří po buněčném dělení. Diplookoky a diplobacily se spojují ve dvojicích. Streptokoky a streptobacily tvoří řetězce. Tetrad koky zůstávají na čtvercích čtyř bakterií. Sarcinae cocci tvoří kostky osmi bakterií a stafylokoky tvoří shluky.
Identifikace bakterie
Pokud máte neznámou bakterii a chcete ji identifikovat, obvykle provedete gramové barvení a poté sledujete vzhled kolonie a jednotlivé rysy. V tu chvíli můžete říci, že máte například gramnegativní aerobní streptobacily. Poté můžete porovnat svůj vzorek s různými známými bakteriemi umístěním na různá kultivační média podporovat růst některých druhů a potlačovat jiné, nebo testováním vzorku na různé známé bakterie vedlejší produkty. Jako poslední možnost může sekvenování DNA určit, zda máte známý nebo neznámý bakteriální druh nebo kmen, za předpokladu, že jej porovnáváte s druhem nebo kmenem, jehož genom již byl sekvenován.