Peptidy jsou krátké polymerní fragmenty složené z aminokyselin. Každý peptid má určitou aminokyselinovou sekvenci označenou třípísmenným nebo jednopísmenným kódem; například aminokyselina alanin je zkrácena jako „Ala“ nebo „A.“ Náplň peptidů v roztoku závisí na kyselosti roztoku. Izoelektrický bod (pl) označuje hodnotu kyselosti roztoku, při které má peptidová molekula čistý náboj nula. Rozpustnost peptidu je v izoelektrickém bodě minimální. Použijte dostupné webové servery k výpočtu hodnoty pI pro peptidovou aminokyselinovou sekvenci.
Napište peptidovou sekvenci pomocí jednopísmenného kódu. Například pokud má peptid aminokyselinovou sekvenci Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (alanin - serin - kyselina glumatická - leucin - prolin), potom je jednopísmenná sekvence „ASELP“. V případě potřeby nahlédněte do převodní tabulky na tři písmena z jednoho písmene uvedené v Zdroje.
K navigaci na server, který vypočítává izoelektrický bod peptidu (pI), použijte libovolný webový prohlížeč, například Internet Explorer nebo Firefox; viz zdroje.
Odečtěte hodnotu izoelektrického bodu (pI) uvedenou v řádku „Teoretická hodnota pI / Mw.“ V našem příkladu je pi 4,00. Všimněte si, že server také vypočítává molekulovou hmotnost (Mw) peptidu.
o autorovi
Oxana Fox je spisovatelka na volné noze se specializací na medicínu a léčbu, počítačový software a hardware, digitální fotografii a finanční služby. V roce 1988 absolvovala Moskevskou lékařskou fakultu s formálním výcvikem v pediatrii.
Fotografické kredity
Comstock Images / Comstock / Getty Images