Přírodní mokřad je složitý ekosystém. Stejně jako ostatní ekosystémy, ať už na pevnině nebo na vodě, ovlivňuje podobu a funkci mokřadů mnoho faktorů. Biotické i abiotické faktory a procesy jsou nedílnou součástí přirozeného mokřadního ekosystému. Termín „biotický“ označuje živé věci. Termín „abiotický“ označuje materiály, procesy nebo faktory, které nežijí.
Voda
Voda sama o sobě je možná podstatným abiotickým faktorem v přírodních mokřadech. I když je voda nezbytná pro téměř všechny biologické procesy, sama o sobě nežije a může se vyskytovat nezávisle na živých věcech. V přírodních mokřadech je voda prostředím, ve kterém existuje a funguje celý ekosystém. Mokřady v regionech, které byly v minulosti zaledněné - v podobě mohutných ledových příkrovů - mohou za své rané počátky vděčit silným řezbářským účinkům ledovce. Dokonce i voda v této dramaticky odlišné formě byla významným faktorem ve vývoji mokřadů.
Vzduch
Na rozdíl od vody je vzduch složen z více než jedné chemické sloučeniny. Kyslík, dusík, oxid uhličitý a několik dalších plynných látek tvoří chemické složení vzduchu. Vzduch, zejména kyslík v něm obsažený, je dalším kritickým abiotickým faktorem v přírodních mokřadech. Prakticky jakýkoli mokřadní ekosystém obsahuje mnoho druhů rostlin a živočichů. Zelené rostliny využívají oxid uhličitý ze vzduchu; zase uvolňují kyslík jako odpadní produkt. Zvířata dělají inverzní; přijímají a používají kyslík a uvolňují oxid uhličitý jako odpadní produkt. Ačkoli existují organismy, které mohou a žijí a rostou bez kyslíku, drtivá většina z nich formy života v přírodní mokřadu - jak pod vodou, tak nad jejím povrchem - vyžadují kyslík z vzduch.
Sluneční světlo
Světlo ze slunce je základním abiotickým faktorem v přírodních mokřadech. Sluneční světlo poskytuje energii, kterou rostliny potřebují k provádění fotosyntézy. Stejná energie se přenáší na další organismy v mokřadu prostřednictvím potravinového řetězce nebo potravního pásu. A teplota je samozřejmě abiotický faktor přímo související s množstvím energie, kterou mokřad přijímá ze slunce.
Minerály
Pod vodou, na dně přírodní mokřadu, jsou usazené materiály různých druhů. Velká část tohoto materiálu je organická nebo biotická a pochází z rozkládajících se zbytků živých organismů v mokřadu. Tento sedimentární materiál však obsahuje i minerální složku. Minerální částice různých druhů a velikostí se mísí s organickým materiálem. Stejně jako v suchozemských ekosystémech musí rostliny v přirozené mokřadě získávat abiotické minerální živiny, aby mohly žít a růst. A minerály se neomezují pouze na spodní sedimenty; mohou být rozpuštěny přímo do vody, kde tvoří komplexní přírodní chemickou směs, která má vliv na faktory, jako je pH, míra kyselosti ve vodě.
Skály
Kromě relativně malých částic minerálních sedimentů jsou v mokřadech často i větší horniny různých velikostí a druhů. Ať už jde o masivní souvislou vrstvu podloží pod mokřadem a tvořící její základ, nebo relativně menší horniny, které jsou pod vodou nebo vyčnívají nad hladinu, jsou v mnoha případech významným abiotickým faktorem mokřady. Kromě poskytnutí substrátů pro rostliny a zvířata, aby na nich buď rostly, nebo okouna, prosakovaly přirozené procesy zvětrávání - postupně se rozpadají a dodávají mokřadům minerální živiny ekosystém.
