Krzyżowanie chromosomów, zwane również krzyżowaniem genetycznym, jest normalnym procesem, w którym geny się rekombinują. Rekombinacja zwiększa zmienność genetyczną poprzez rekombinację w celu wytworzenia różnych cech.
TL; DR (zbyt długi; Nie czytałem)
Interferencja genów jest miarą niezależności zwrotnic od siebie. Jeśli zwrotnica w jednym regionie wpływa na zwrotnicę w innym regionie, interakcja ta nazywana jest interferencją. Zakłócenia = 1 − c.o.c., gdzie c.o.c. jest współczynnikiem zbieżności (c.o.c.)
Ludzie mają 23 chromosomy. Podczas mejozy jedna komórka dzieli się dwukrotnie, tworząc cztery komórki potomne. Te cztery komórki potomne mają połowę liczby chromosomów komórki rodzicielskiej. Mogą następnie połączyć się z inną połową chromosomu z komórki jajowej lub plemnika, tworząc całą parę.
Czasami te dwie części nie trzymają się razem. Jeśli kawałki pękną, mogą połączyć się z innym odłamanym kawałkiem. Dwie kopie genetyczne, które ulegają rekombinacji, nazywane są chromatydami. Problemy takie jak zespół Downa lub inne zaburzenia genetyczne mogą być spowodowane nieprawidłowym połączeniem genów.
Większość zwrotnic występuje normalnie. Czasami występuje podwójna zwrotnica. Dzieje się tak, gdy chromatydy łączą się w dwóch punktach zamiast w jednym. W drugim punkcie kontaktu chromatydy mogą ponownie oddzielić się i ponownie wymienić informację genetyczną.
Interferencja genów jest miarą niezależności zwrotnic od siebie. Innymi słowy, skoro wiesz, że dochodzi do podwójnych skrzyżowań, musisz odpowiedzieć na pytanie, czy skrzyżowania w sąsiednich regionach chromosomów są niezależne, czy nie. Jeśli nie są niezależne, oznacza to, że skrzyżowanie w jednym regionie wpływa na prawdopodobieństwo wystąpienia skrzyżowania w sąsiednim regionie. Jeśli zwrotnica w jednym regionie wpływa na zwrotnicę w innym regionie, interakcja ta nazywana jest interferencją.
Jak obliczyć interferencję
Rozważając sposób obliczania kolizji, pierwszym krokiem jest obliczenie współczynnika koincydencji (c.o.c.). C.O.C. z kolei zależy od prawdopodobieństwa podwójnego przecięcia, zwanego wartością częstotliwości przecięcia, znanej również jako „częstotliwość podwójnych rekombinantów”.
Współczynnik zbieżności to stosunek obserwowanych do oczekiwanych podwójnych rekombinantów.
Współczynnik zbieżności = częstość obserwowanych podwójnych rekombinantów / oczekiwana częstość podwójnych rekombinantów
Oczekiwana liczba podwójnych rekombinantów w próbce dwóch niezależnych regionów jest równa iloczynowi częstości rekombinacji w sąsiednich regionach.
Zakłócenia definiuje się wtedy w następujący sposób:
interferencja = 1 − c.o.c.
Interferencja mówi ci, jak silnie crossover w jednym z regionów DNA zakłóca tworzenie crossovera w innym regionie.
Jeżeli interferencja wynosi zero, oznacza to, że podwójne zwrotnice występują zgodnie z przewidywaniami i że zwrotnica w jednym regionie występuje niezależnie od skrzyżowania w sąsiednim regionie.
Jeśli interferencja wynosi 1, oznacza to, że interferencja jest kompletna i nie ma podwójnych zwrotnic zaobserwowano, ponieważ skrzyżowanie w jednym regionie eliminuje prawdopodobieństwo skrzyżowania w sąsiednim region.
Zazwyczaj Twoje dane będą wykazywać interferencję od 0 do 1. Wartości większe od zera, ale mniejsze od jeden wskazują, że występuje interferencja.