19. gadsimtā taksonomija - dzīvo organismu klasifikācija - bija visa bioloģijas dusmas. Gan amatieri, gan profesionālie dabaszinātnieki bija tik ļoti aizrāvušies ar radību savākšanas un identificēšanas trakumu, retas vaboles bija karstas preces. Tajā laikā par mikroorganismiem un to vietu dzīvo būtņu pasaulē bija maz zināms, un mikrobioloģijas klasifikācijai netika pievērsta tik liela uzmanība. Starp gadu desmitiem ir dramatiski palielinājušās zināšanas par mikrobiem un to metodēm - mikroorganismu identificēšana, daļu no šī pieauguma pierāda efektīva mikroorganismu klasifikācija mikroorganismi.
Taksonomijas komponenti
Taksonomijai ir trīs sastāvdaļas: nomenklatūra, klasifikācija un identifikācija. Nomenklatūra vienkārši piešķir sugai nosaukumu. Klasifikācijā sugas tiek sagrupētas pēc kopīgām pazīmēm - dažas no tām ir fiziskas, bet citas bioķīmiskas. Identifikācija ir organisma pazīmju izmantošana, lai noteiktu, kur tas pieder klasifikācijas shēmai. Mūsdienu taksonomiskās shēmas lielākā un visaptverošākā grupa ir domēni. Mazākā grupa ir suga. Sākot ar visaptverošāko un beidzot ar specifiskāko, līmeņi darbojas šādi: domēns, valstība, patvērums, klase, kārtība, ģimene, ģints un sugas. Jūs, piemēram, esat Eukarya Animalia Chordata Mammalia primāts Hominidae Homo sapiens.
Mikroorganismi un domēni
Mikroorganismi ir ārkārtīgi dažādi. Tie nav definēti pēc kāda veida struktūras vai funkcijas, bet vienkārši pēc to lieluma. Mikroorganismi ir tik nirēji, ka tie ietilpst visās trīs dažādās augstākā līmeņa klasifikācijās - visās trijās jomās. Viens domēns ir baktērijas, otrs ir arhejas un galīgais ir eikarja. Visi baktēriju un arheju domēnu pārstāvji ir vienšūnas mikroorganismi. Viņi abi ir šūnas bez membrānām, kas atdala to ģenētisko materiālu no pārējās šūnas - membrānas, kas nosaka kodolu. Tātad visas valstības, phyla, klases, kārtas, ģimenes, ģintis un sugas baktērijās un arheju domēnos ir mikroorganismi.
Vienriteņu protisti
Eukarya ir organismi, kuru šūnās ir kodols. Daudzi eikariotu organismi ir vienšūnas mikroorganismi, bet daudzi citi - piemēram, sarkankoku koki vai jūs - nē. Tāpēc ir nepieciešama papildu klasifikācija. Karaliste Protista domēna Eukarya sastāvā sastāv tikai no vienšūnas mikroorganismiem. Protisti ir sadalīti trīs dažādās phyla grupās: četras dažādas aļģu phyla, četras dažādas vienšūņu phyla un divas dažādas pelējuma phyla. Bet visi šīs phylas organismi - visi Protista valstībā - ir mikroorganismi.
Mikroskopiskās sēnes
Valstība Sēnes ir domēna Eukarya domēnā. Dažas sēņu sēnītes satur mikroorganismus. Piemēram, Zygomycota patvērums satur mikroskopiskas maizes veidnes, un Ascomycota patvērums - raugus, mikrobu kultūru kaitēkļus un parazītus. Ķērpji ir simbiotiska sēnīšu un fotosintētiska organisma kopa - kas daļēji ietilpst sēņu valstībā un daļēji citās valstībās vai pat citās jomās.